MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2027390173 · doi:10.4161/15384101.2014.991194

Distinct cathepsins control necrotic cell death mediated by pyroptosis inducers and lysosome-destabilizing agents

2015· article· en· W2027390173 sur OpenAlexaff
Jürgen Brojatsch, Heriberto Lima, Deborah Palliser, Lee S. Jacobson, Stefan M. Muehlbauer, Raquel Furtado, David L. Goldman, Michael P. Lisanti, Kartik Chandran

Notice bibliographique

RevueCell Cycle · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammasome and immune disorders
Établissements canadiensInstitute of Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious Diseases
Mots-clésPyroptosisCathepsinProgrammed cell deathCathepsin BLysosomeBiologyCathepsin L1Cell biologyCathepsin DCathepsin LApoptosisBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Necrotic cell death triggers a range of biological responses including a strong adaptive immune response, yet we know little about the cellular pathways that control necrotic cell death. Inhibitor studies suggest that proteases, and in particular cathepsins, drive necrotic cell death. The cathepsin B-selective inhibitor CA-074-Me blocks all forms of programmed necrosis by an unknown mechanism. We found that cathepsin B deficiency does not prevent induction of pyroptosis and lysosome-mediated necrosis suggesting that CA-074-Me blocks necrotic cell death by targeting cathepsins other than cathepsin B. A single cathepsin, cathepsin C, drives necrotic cell death mediated by the lysosome-destabilizing agent Leu-Leu-OMe (LLOMe). Here we present evidence that cathepsin C-deficiency and CA-074-Me block LLOMe killing in a distinct and cell type-specific fashion. Cathepsin C-deficiency and CA-074-Me block LLOMe killing of all myeloid cells, except for neutrophils. Cathepsin C-deficiency, but not CA-074-Me, blocks LLOMe killing of neutrophils suggesting that CA-074-Me does not target cathepsin C directly, consistent with inhibitor studies using recombinant cathepsin C. Unlike other cathepsins, cathepsin C lacks endoproteolytic activity, and requires activation by other lysosomal proteases, such as cathepsin D. Consistent with this theory, we found that lysosomotropic agents and cathepsin D downregulation by siRNA block LLOMe-mediated necrosis. Our findings indicate that a proteolytic cascade, involving cathepsins C and D, controls LLOMe-mediated necrosis. In contrast, cathepsins C and D were not required for pyroptotic cell death suggesting that distinct cathepsins control pyroptosis and lysosome-mediated necrosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCell CycleMême sujetInflammasome and immune disordersTravaux en français237 207