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Genome interplay in the grain transcriptome of hexaploid bread wheat

2014· article· en· 362 citations· W2028145262 sur OpenAlex· 10.1126/science.1250091

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Organisme subventionnaire canadienUn organisme canadien l'a financé. Le travail peut ne porter aucune affiliation canadienne.

Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants
0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

Allohexaploid bread wheat (Triticum aestivum L.) provides approximately 20% of calories consumed by humans. Lack of genome sequence for the three homeologous and highly similar bread wheat genomes (A, B, and D) has impeded expression analysis of the grain transcriptome. We used previously unknown genome information to analyze the cell type-specific expression of homeologous genes in the developing wheat grain and identified distinct co-expression clusters reflecting the spatiotemporal progression during endosperm development. We observed no global but cell type- and stage-dependent genome dominance, organization of the wheat genome into transcriptionally active chromosomal regions, and asymmetric expression in gene families related to baking quality. Our findings give insight into the transcriptional dynamics and genome interplay among individual grain cell types in a polyploid cereal genome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

La notice

Revue
Science
Thématique
Wheat and Barley Genetics and Pathology
Domaine
Agricultural and Biological Sciences
Établissements canadiens
Organismes subventionnaires
Bayer CropScienceGenome PrairieBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilInstitut National de la Recherche AgronomiqueNorges ForskningsrådAgence Nationale de la RechercheTürkiye Bilimsel ve Teknolojik Araştırma KurumuFrance AgriMerBundesministerium für Bildung und ForschungMinistry of Agriculture, Forestry and FisheriesOffice of ScienceGrains Research and Development CorporationInternational Center for Agricultural Research in the Dry AreasKansas Wheat CommissionEuropean Molecular Biology LaboratoryArcadia FundScottish GovernmentRural and Environment Science and Analytical Services DivisionDeutsche ForschungsgemeinschaftMinistry of Agriculture - SaskatchewanGenome CanadaDirectorate for Biological SciencesJoint Genome InstituteGrantová Agentura České RepublikyGatsby Charitable FoundationWestern Grains Research FoundationU.S. Department of AgricultureEuropean CommissionU.S. Department of Energy
Mots-clés
TranscriptomeGenomeBiologyWheat grainGeneticsComputational biologyAgronomyGeneGene expression
Résumé présent dans OpenAlex
oui