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Enregistrement W2028362556 · doi:10.1371/journal.pone.0032964

The Colocalization Potential of HIV-Specific CD8+ and CD4+ T-Cells is Mediated by Integrin β7 but Not CCR6 and Regulated by Retinoic Acid

2012· article· en· W2028362556 sur OpenAlexafffund
Vanessa Sue Wacleche, Nicolas Chomont, Annie Gosselin, Patricia Monteiro, Mathieu Goupil, Hassen Kared, Cécile Tremblay, Nicole F. Bernard, Mohamed‐Rachid Boulassel, Jean-Pierre Routy, Petronela Ancuța

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensMcGill University Health CentreUniversité de MontréalCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteCanadian Institutes of Health ResearchNational Center for Research ResourcesGIS-Institut des Maladies RaresFondation de FranceFondation du CHUMInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleStyrelsen för Internationellt Utvecklingssamarbete
Mots-clésC-C chemokine receptor type 6BiologyCytotoxic T cellCD8Jurkat cellsInterleukin 21Cell biologyCD28T cellMolecular biologyImmunologyImmune systemIn vitroChemokine receptorChemokineBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CD4(+) T-cells from gut-associated lymphoid tissues (GALT) are major targets for HIV-1 infection. Recruitment of excess effector CD8(+) T-cells in the proximity of target cells is critical for the control of viral replication. Here, we investigated the colocalization potential of HIV-specific CD8(+) and CD4(+) T-cells into the GALT and explored the role of retinoic acid (RA) in regulating this process in a cohort of HIV-infected subjects with slow disease progression. The expression of the gut-homing molecules integrin β7, CCR6, and CXCR3 was identified as a "signature" for HIV-specific but not CMV-specific CD4(+) T-cells thus providing a new explanation for their enhanced permissiveness to infection in vivo. HIV-specific CD8(+) T-cells also expressed high levels of integrin β7 and CXCR3; however CCR6 was detected at superior levels on HIV-specific CD4(+) versus CD8(+) T-cells. All trans RA (ATRA) upregulated the expression of integrin β7 but not CCR6 on HIV-specific T-cells. Together, these results suggest that HIV-specific CD8(+) T-cells may colocalize in excess with CD4(+) T-cells into the GALT via integrin β7 and CXCR3, but not via CCR6. Considering our previous findings that CCR6(+)CD4(+) T-cells are major cellular targets for HIV-DNA integration in vivo, a limited ability of CD8(+) T-cells to migrate in the vicinity of CCR6(+)CD4(+) T-cells may facilitate HIV replication and dissemination at mucosal sites.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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