Tyrocidine a from a haliclona sponge derived Vibrio sp
Notice bibliographique
Résumé
Taxonomically diverse, sponge-associated microbial communities represent a rich source of potentially novel and bioactive natural products. In our search for bioactive compounds from sponge-associated microbes we isolated and identified a Vibrio sp. from a sample of Haliclona collected from Milne Bay, Papua New Guinea. The Vibrio strain was selected for further investigation on the basis of testing positive for the presence of non-ribosomal peptide synthetase (NRPS) coding genes in our PCR-based screen. Chemical investigation of this Vibrio sp. resulted in the isolation and identification of the NRPS product tyrocidine A, and its decapeptide structure was confirmed by 1D and 2D NMR. Tyrocidine A displayed moderate activity against methicillin resistant S. aureus , E. coli and P. aeruginosa. The discovery of tyrocidine A from a marine Vibrio sp is intriguing from a microbiological viewpoint as it has long been known to be a product of the Gram-positive, soil-dwelling and spore forming Bacillus spp. Aspects of this, and the notion that the marine environment is a largely untapped source of bioactive natural products will be presented.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».