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Enregistrement W2028381398 · doi:10.1055/s-0032-1320761

Tyrocidine a from a haliclona sponge derived Vibrio sp

2012· article· en· W2028381398 sur OpenAlexaff
JC Noro, John A. Kalaitzis, DE Williams, Doralyn S. Dalisay, R. J. Andersen, BA Neilan

Notice bibliographique

RevuePlanta Medica · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMarine Sponges and Natural Products
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSpongeVibrioBiologyBayRibosomal RNANew guineaBacteriaMicrobiologyZoologyEcologyGeneGeneticsBotanyGeographyArchaeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Taxonomically diverse, sponge-associated microbial communities represent a rich source of potentially novel and bioactive natural products. In our search for bioactive compounds from sponge-associated microbes we isolated and identified a Vibrio sp. from a sample of Haliclona collected from Milne Bay, Papua New Guinea. The Vibrio strain was selected for further investigation on the basis of testing positive for the presence of non-ribosomal peptide synthetase (NRPS) coding genes in our PCR-based screen. Chemical investigation of this Vibrio sp. resulted in the isolation and identification of the NRPS product tyrocidine A, and its decapeptide structure was confirmed by 1D and 2D NMR. Tyrocidine A displayed moderate activity against methicillin resistant S. aureus , E. coli and P. aeruginosa. The discovery of tyrocidine A from a marine Vibrio sp is intriguing from a microbiological viewpoint as it has long been known to be a product of the Gram-positive, soil-dwelling and spore forming Bacillus spp. Aspects of this, and the notion that the marine environment is a largely untapped source of bioactive natural products will be presented.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
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Résumé présentoui

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