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Enregistrement W2028680775 · doi:10.1089/dna.2006.25.104

Cloning and Functional Characterization of the Murine Caspase-3 Gene Promoter

2006· article· en· W2028680775 sur OpenAlexafffund
Laurent Sabbagh, Martin Bourbonnière, François Denis, Rafick‐Pierre Sékaly

Notice bibliographique

RevueDNA and Cell Biology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell death mechanisms and regulation
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche ScientifiqueArmand Frappier MuseumUniversité de MontréalMcGill UniversityCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMedical Research Council CanadaCanada Research ChairsAlzheimer Society
Mots-clésBiologyPromoterMolecular biologyJurkat cellsGeneTranscription factorUntranslated regionReporter geneRegulation of gene expressionLuciferaseGene expressionCaspaseGeneticsCell biologyTransfectionProgrammed cell deathApoptosisT cellMessenger RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Several studies have shown that the levels of caspase-3 are upregulated under different conditions of apoptosis. Previously, we have shown that activation of T cells through the TCR leads to the upregulation of caspase-3 levels. These findings highlight the importance of regulating the expression of caspase-3 in order to prevent premature cell death. To better understand the regulation of the caspase-3 gene, a portion of the 5'- untranslated region was cloned, sequenced, and characterized. The segment of the 5'-flanking region of the caspase-3 gene was also cloned upstream of a luciferase reporter gene, demonstrating that this fragment contains promoter activity. Higher luciferase expression was found with several of the promoter deletion constructs in Jurkat T cells but not the mouse Neuro-2A neuroblastoma cell line, suggesting the presence of a T-cell-specific regulated region. The importance of these sequences is further supported by the genomic organization of the human and mouse caspase-3 promoter regions. These findings demonstrated that the -2245/+14 region of the caspase-3 promoter shows constitutive levels of expression, and that several regions of the promoter play a role in basal regulation. Finally, some of the conserved transcription factor binding sites identified between the human and mouse promoters appear to play an important role in lymphoid cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,172
Écart entre enseignants0,168 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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