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Enregistrement W2028702634 · doi:10.1089/107999001750277853

The Interferon-Inducible Stat2:Stat1 Heterodimer Preferentially Binds <i>In Vitro</i> to a Consensus Element Found in the Promoters of a Subset of Interferon-Stimulated Genes

2001· article· en· W2028702634 sur OpenAlex
Julien Ghislain, Thomas Shing-Hei Wong, Melody H.-H. Nguyen, Eleanor N. Fish

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Interferon & Cytokine Research · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytokine Signaling Pathways and Interactions
Établissements canadiensUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSTAT2STAT1EnhancerResponse elementSTAT proteinPromoterSTAT4BiologyInterferonTranscription factorMolecular biologyGeneConsensus sequenceTranscription (linguistics)STAT3Gene expressionGeneticsstatPeptide sequence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Regulated expression of type I interferon (IFN)-stimulated genes (ISG) requires the binding of the signal transducer and activator of transcription (Stat) complexes to enhancer elements located in the ISG promoters. These enhancer elements include the IFN-stimulated response element (ISRE) and the palindromic IFN-gamma activation site (GAS) element. Regulated expression of ISRE containing ISG depends on IFN-stimulated gene factor 3 (ISGF3), a heterodimer involving Stat1 and Stat2 in association with a DNA-binding adapter protein, p48/IFN regulatory factor-9 (IRF-9). Several GAS binding Stat complexes involving Stat1, Stat3, Stat4, and Stat5 have been described, but their contribution to GAS-dependent ISG expression remains to be established. We and others previously identified an IFN-alpha-inducible Stat2:1 heterodimer that exhibits binding to the GAS element of the IRF-1 gene. These previous studies raise the possibility that Stat2:1 may participate in the transcriptional activation of the subset of ISG containing GAS elements. To address this question, we performed a PCR-assisted binding site selection procedure to define the Stat2:1 recognition sequence. The data reveal that Stat2:1 preferentially binds to a palindromic sequence similar to the consensus GAS element found in the promoter of several ISG. Our results establish that in addition to the classic complex formation involving Stat2, Stat1, and p48 associations, Stat2:1 heterodimers are formed in response to IFN treatment that may play an important role in the transcriptional regulation of certain ISG.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,870

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,117
Tête enseignante GPT0,411
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle