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Enregistrement W2028845652 · doi:10.1099/ijs.0.036848-0

Terrimonas pekingensis sp. nov., isolated from bulking sludge, and emended descriptions of the genus Terrimonas , Terrimonas ferruginea , Terrimonas lutea and Terrimonas aquatica

2012· article· en· W2028845652 sur OpenAlexfundno aff
Decai Jin, Ping Wang, Zhihui Bai, Bo Jin, Zhisheng Yu, Xinxin Wang, Guoqiang Zhuang, Hongxun Zhang

Notice bibliographique

RevueINTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesKey Technologies Research and Development ProgramBeef Cattle Research Council
Mots-clésBiology16S ribosomal RNAPhylogenetic treeStrain (injury)GenusMicrobiologyBotanyBacteriaGeneGeneticsAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A Gram-negative, strictly aerobic, non-motile and non-spore-forming rod that produced white, viscous colonies, designated QH(T), was isolated from bulking sludge collected from a municipal wastewater treatment plant in Beijing, China. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences showed that strain QH(T) belonged to the genus Terrimonas and shared 96.3 % sequence similarity with Terrimonas lutea DY(T), 94.1 % with Terrimonas ferruginea ATCC 13524(T) and 93.8 % with Terrimonas aquatica RIB1-6(T). Strain QH(T) contained iso-C15 : 0, summed feature 3 (comprising one or more of C16 : 1ω7c, C16 : 1ω6c and iso-C15 : 0 2-OH) and iso-C15 : 1 G as the predominant fatty acids. The predominant polar lipid of strain QH(T) and members of the genus Terrimonas was phosphatidylethanolamine. The major isoprenoid quinone of strain QH(T) was MK-7 and the DNA G+C content was 41.0 mol%. DNA-DNA relatedness between strain QH(T) and T. lutea BCRC 17944(T), T. ferruginea BCRC 17943(T) and T. aquatica BCRC 17941(T) was 32, 23 and 22 %, respectively. On the basis of phylogenetic inference, differential phenotypic data and low DNA-DNA relatedness with members of the genus Terrimonas, strain QH(T) represents a novel species, for which the name Terrimonas pekingensis sp. nov. is proposed. The type strain is QH(T) ( = CICC 10452(T) = NCCB 100397(T)). The descriptions of the genus Terrimonas and T. ferruginea, T. lutea and T. aquatica are also emended.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,849
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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