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Enregistrement W2029660372 · doi:10.1074/jbc.m110.163709

MyoD Directly Up-regulates Premyogenic Mesoderm Factors during Induction of Skeletal Myogenesis in Stem Cells

2010· article· en· W2029660372 sur OpenAlexafffund
Peter J. Gianakopoulos, Virja Mehta, Anastassia Voronova, Yi Cao, Zizhen Yao, Josée Coutu, Xiaonan Wang, Michelle S. Waddington, Stephen J. Tapscott, Ilona S. Skerjanc

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensUniversity of OttawaWestern University
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMyoDMyogeninMyogenesisMYF5Myogenic regulatory factorsPITX2PAX3BiologyMesodermSkeletal muscleMyocyteMyoD ProteinCell biologyMolecular biologyGeneticsEndocrinologyTranscription factorHomeoboxEmbryonic stem cellGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gain- and loss-of-function experiments have illustrated that the family of myogenic regulatory factors is necessary and sufficient for the formation of skeletal muscle. Furthermore, MyoD required cellular aggregation to induce myogenesis in P19 embryonal carcinoma stem cells. To determine the mechanism by which stem cells can be directed into skeletal muscle, a time course of P19 cell differentiation was examined in the presence and absence of exogenous MyoD. By quantitative PCR, the first MyoD up-regulated transcripts were the premyogenic mesoderm factors Meox1, Pax7, Six1, and Eya2 on day 4 of differentiation. Subsequently, the myoblast markers myogenin, MEF2C, and Myf5 were up-regulated, leading to skeletal myogenesis. These results were corroborated by Western blot analysis, showing up-regulation of Pax3, Six1, and MEF2C proteins, prior to myogenin protein expression. To determine at what stage a dominant-negative MyoD/EnR mutant could inhibit myogenesis, stable cell lines were created and examined. Interestingly, the premyogenic mesoderm factors, Meox1, Pax3/7, Six1, Eya2, and Foxc1, were down-regulated, and as expected, skeletal myogenesis was abolished. Finally, to identify direct targets of MyoD in this system, chromatin immunoprecipitation experiments were performed. MyoD was observed associated with regulatory regions of Meox1, Pax3/7, Six1, Eya2, and myogenin genes. Taken together, MyoD directs stem cells into the skeletal muscle lineage by binding and activating the expression of premyogenic mesoderm genes, prior to activating myoblast genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil0,537

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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