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Enregistrement W2029702664 · doi:10.1152/ajprenal.00082.2004

Use of phospho-specific antibodies to determine the phosphorylation of endogenous Na<sup>+</sup>/H<sup>+</sup> exchanger NHE3 at PKA consensus sites

2005· article· en· W2029702664 sur OpenAlexaff
Hetal S. Kocinsky, Adriana C. C. Girardi, Daniel Biemesderfer, Thao Nguyen, SueAnn Mentone, John Orlowski, Peter S. Aronson

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Renal Physiology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases
Mots-clésPhosphorylationSerineMolecular biologyPolyclonal antibodiesChemistryIn vivoKinaseWestern blotProtein phosphorylationEndogenyProtein kinase ABiologyAntibodyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Transfection studies using mutant constructs have implicated one or both protein kinase A (PKA) consensus phosphorylation sites [serines 552 and 605 in rat Na(+)/H(+) exchanger type 3 (NHE3)] as critical for mediating inhibition of NHE3 in response to several stimuli including dopamine. However, whether one or both of these sites is actually phosphorylated in endogenous NHE3 in proximal tubule cells is unknown. The purpose of this study was to generate phosphospecific antibodies so that the state of phosphorylation of these serine residues in endogenous NHE3 could be assessed in vitro and in vivo. To this end, polyclonal and monoclonal phosphospecific peptide antibodies were generated against each PKA consensus site. Phosphospecificity was established by ELISA and Western blot assays. We then used these antibodies in vitro to evaluate the effect of dopamine on phosphorylation of the corresponding PKA sites (serines 560 and 613) in NHE3 endogenously expressed in opossum kidney cells. Baseline phosphorylation of both sites was detected that was significantly increased by dopamine. Next, we determined the baseline phosphorylation state of each serine in rat kidney NHE3 in vivo. We found that serine 552 of NHE3 is phosphorylated to a much greater extent than serine 605 at baseline in vivo. Moreover, we detected a distinct subcellular localization for NHE3 phosphorylated at serine 552 compared with total NHE3. Specifically, NHE3 phosphorylated at serine 552 localized to the coated pit region of the brush-border membrane, where NHE3 is inactive, while total NHE3 was found throughout the brush-border membrane. These findings strongly suggest that phosphorylation of NHE3 plays a role in its subcellular trafficking in vivo. In conclusion, we successfully generated phosphospecific antibodies that should be useful to assess the phosphorylation of endogenous NHE3 at its two PKA consensus sites under a variety of physiological conditions in vitro and in vivo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,029

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations121
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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