Development of Protein-based Inhibitors of the Proprotein of Convertase SKI-1/S1P
Notice bibliographique
Résumé
Processing of membrane-bound transcription factors such as sterol regulatory element-binding proteins (SREBPs) and the ER-stress response factor ATF6, and glycoproteins of some hemorrhagic fever viruses are initiated by the proprotein convertase SKI-1/S1P. So far, no cellular protein-based inhibitor of the hydrophobic-amino acid specific SKI-1 is known. The prosegment of the basic-amino acid specific convertases (e.g. furin and PC5) or alpha(1)-PDX, a variant of alpha(1)-antitrypsin (alpha(1)-AT) exhibiting an RIPR(358) sequence at the reactive site loop, were shown to potently inhibit these secretory proteinases. Accordingly, we tested the SKI-1-inhibitory potential of various point mutants of either the 198 amino acid preprosegment of SKI-1-(1-198) or alpha(1)-AT. Transient transfections data showed that, out of numerous mutants studied, the R134E prosegment mutant or the alpha(1)-AT reactive site loop variants RRVL(358), RRYL(358) and RRIL(358) are the best specific cellular inhibitors of SKI-1. The observed inhibition of the processing of endogenous SREBP-2, exogenous ATF6 and a PDGF-A (RRLL(86)) variant were >55% and reach approximately 80% in stable transfectants. We also show that SKI-1 forms SDS-stable complexes with these alpha(1)-AT variants, but not with wild-type alpha(1)-AT or alpha(1)-PDX. Finally, these inhibitors were also shown to affect the processing and stability of the Crimean-Congo hemorrhagic fever virus glycoprotein.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».