Distinct Contributions of the Lectin and Arm Domains of Calnexin to Its Molecular Chaperone Function
Notice bibliographique
Résumé
Calnexin is a Ca2+-binding transmembrane chaperone of the endoplasmic reticulum that recognizes Glc1Man5-9GlcNAc2 oligosaccharides on folding glycoproteins as well as non-native elements of the polypeptide backbone. This latter mode of recognition enables calnexin to suppress the aggregation of both glycosylated and nonglycosylated substrates. The luminal portion of calnexin (S-Cnx) consists of two domains, a globular lectin domain and an extended arm domain. To understand the function of these domains during the interaction of calnexin with non-native protein conformers, we tested deletion mutants of S-Cnx for their abilities to suppress the aggregation of nonglycosylated firefly luciferase. The arm domain alone exhibited no capacity to suppress aggregation. However, stepwise truncation of the arm domain in S-Cnx resulted in a progressive reduction in aggregation suppression potency to the point where the globular domain alone exhibited 25% potency. To characterize the polypeptide-binding site, we used hydrophobic peptides that were competitors of the ability of S-Cnx to suppress luciferase aggregation. Direct binding experiments revealed a single site of peptide binding in the globular domain (Kd = 0.9 microm) at a location distinct from the lectin site. Progressive truncation of the arm domain in S-Cnx had no effect on the binding of small peptides but reduced the binding affinity of S-Cnx for large, non-native protein substrates. Because protein substrates exhibited no binding to the isolated arm domain, our findings support a model in which calnexin suppresses aggregation through a polypeptide-binding site in its globular domain, with the arm domain enhancing aggregation suppression by sterically constraining large substrates.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».