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Enregistrement W2030963502 · doi:10.1021/jm500544p

Prodrug-Inspired Probes Selective to Cathepsin B over Other Cysteine Cathepsins

2014· article· en· W2030963502 sur OpenAlexafffund
Morshed Alam Chowdhury, I.A. Moya, Shardul Bhilocha, Cody C. McMillan, Brady G. Vigliarolo, Ingeborg Zehbe, Christopher P. Phenix

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensNOSM UniversityLakehead UniversityThunder Bay Regional Research Institute
Organismes subventionnairesCanadian Cancer Society Research InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCathepsinCathepsin BProteasesProdrugChemistryCysteineCysteine proteaseBiochemistryCathepsin SEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cathepsin B (CTB) is a cysteine protease believed to be an important therapeutic target or biomarker for several diseases including aggressive cancer, arthritis, and parasitic infections. The development of probes capable of assessing CTB activity in cell lysates, living cells, and animal models of disease are needed to understand its role in disease progression. However, discovering probes selective to cathepsin B over other cysteine cathepsins is a significant challenge due to overlap of preferred substrates and binding site homology in this family of proteases. Herein we report the synthesis and detailed evaluation of two prodrug-inspired fluorogenic peptides designed to be efficient and selective substrate-based probes for CTB. Through cell lysate and cell assays, a promising lead candidate was identified that is efficiently processed and has high specificity for CTB over other cysteine cathepsins. This work represents a key step toward the design of rapid release prodrugs or substrate-based molecular imaging probes specific to CTB.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,049
Score d'incertitude au seuil0,624

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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