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Enregistrement W2031028063 · doi:10.1186/1753-6561-5-s7-p176

Proteomic analysis of Clostridium acetobutylicumin butanol production from lignocellulosic biomass

2011· article· en· W2031028063 sur OpenAlexaff
Kumaran Sivagnanam, Vijaya G.S. Raghavan, Manesh Shah, Nathan C. VerBerkmoes, Robert L. Hettich, Mark Lefsrud

Notice bibliographique

RevueBMC Proceedings · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiofuel production and bioconversion
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésClostridium acetobutylicumButanolLignocellulosic biomassBiofuelBiomass (ecology)FermentationBiotechnologyBioenergyPulp and paper industryChemistryFood scienceBiochemical engineeringBiochemistryBiologyAgronomyEthanolEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plant biomass is an abundant and renewable source of energy rich carbohydrates that can be efficiently converted by microbes into biofuels. Butanol is considered as a second generation biofuel when it is produced from lignocellulosic biomass comprising of agricultural and garden wastes that does not compete with the food supplies. Clostridium acetobutylicum is a gram positive, spore forming, obligately anaerobic bacteria capable of converting different sugars from lignocellulosic biomass to butanol through acetone – butanol – ethanol (ABE) fermentation process. However, the production of butanol from ABE fermentation process is not economically viable and studies have been performed to understand the utilization of lignocellulosic biomass and regulation of butanol production to improve butanol productivity. Successful industrial butanol production process through ABE fermentation requires complete understanding of the C .acetobutylicum. Shotgun proteomics provides a direct approach to study the whole proteome of an organism at molecular level in depth. Therefore, this paper focuses on shotgun proteomic profiling of C. acetobutylicum ATCC 824 from butanol fermentation process, elucidating the molecular functional mechanisms of C.acetobutylicum in butanol production.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,733

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,174 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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