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Enregistrement W2031065137 · doi:10.1186/1471-2334-14-s2-o14

IDO-induced immunosuppressive tryptophan catabolism following primary HIV infection

2014· article· en· W2031065137 sur OpenAlexaff
Mohammad-Ali Jenabian, Kishanda Vyboh, Ido P. Kema, Cynthia Kanagaratham, Danuta Radzioch, Norbert Gilmore, Petronela Ancuța, Cécile Tremblay, Jean‐Pierre Routy

Notice bibliographique

RevueBMC Infectious Diseases · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de MontréalUniversité de MontréalMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPeripheral blood mononuclear cellInterleukin-3 receptorImmunologyCD38MedicineCatabolismCD11cFlow cytometryInternal medicineBiologyCD34MetabolismBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We showed in cross-sectional studies that tryptophan (Trp) catabolism into kynurenine (Kyn) by IDO enzyme expressed by dendritic cells (DC) contributes to regulatory T-cells (Tregs) expansion and immune suppression in chronic HIV infection. We prospectively assessed Trp catabolism and anti-inflammatory response following primary HIV infection (PHI). Plasma and Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) were longitudinally collected in 41 PHI patients (infection <90 days), 24 remained untreated (ART-naive) and 17 were ART-treated one year later. In addition, samples from elite controllers (EC, n=12) and healthy subjects (HS, n=12) were also assessed. IDO enzymatic activity marker (Kyn/Trp ratio) was measured by isotope dilution tandem mass spectrometry. IL-6, IL-18, TNF-α and IP-10 plasma levels were assessed by Luminex. Frequency of Tregs (CD4+CD25highCD127lowFOXP3high), CD11c+ myeloid DC (mDC) and CD123+ plasmacytoid DC (pDC) as well as HLA-DR/CD38 co-expression of on T-cells were assessed. PHI patients had elevated Kyn/Trp ratio compared to HS and EC and further increased during the chronic phase, while normalized following ART. Accordingly, an increase of Treg frequency was observed at the baseline and continues to increase in the chronic phase only for those remaining untreated, when compared to HS and EC. Conversely, the frequency of mDC and pDC decreases over time only for those who remained untreated. Higher Kyn/Trp ratios were inversely correlated with the frequency of mDC and pDC at PHI and for those untreated. Importantly, the highest level of immune activation (HLA-DR+CD38+ CD8 T-cells) was observed during PHI followed by a decrease in chronic phase in ART-naïve and became comparable to EC and HS when receiving ART. Importantly, Kyn/Trp ratio was correlated with level of CD8 T-cell activation during PHI and for those who remained untreated. In line with this, positive correlations were observed between Kyn/Trp ratio and levels of IL-18 and TNF-α as well as markers of HIV disease progression IL-6 and IP-10. The progressive increase of Kyn/Trp ratio observed in the chronic phase of HIV infection in contrast to decreased viral load and T-cell activation, support the contribution of tissue damage and/or myeloid inflammatory syndrome in addition to viral replication for the development of immunosuppression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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