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Enregistrement W2031638626 · doi:10.4236/oji.2014.43012

Memory Phenotypes of HIV-Specific CD8+ T Cell Responses Are Independent of Functional Activity as Defined by Cytokine Output

2014· article· en· W2031638626 sur OpenAlexafffund
Meika Richmond, Sandra Kiazyk, Lyle R. McKinnon, Billy Nyanga, Charles Wachihi, Makubo Kimani, Joshua Kimani, Francis A. Plummer, T. Blake Ball

Notice bibliographique

RevueOpen Journal of Immunology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchGovernment of CanadaNational Institutes of HealthVaccine Research CenterNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesManitoba Health Research Council
Mots-clésPhenotypeCD8C-C chemokine receptor type 7Flow cytometryBiologyImmunologyCytotoxic T cellCytokineAntigenT cellCell biologyImmune systemIn vitroGeneticsGeneChemokine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objectives: The definition of CD8+ T cell attributes that mediate protective immunity in HIV dis-ease progression has not been clearly defined. Although our ability to characterize these cells continues to improve, the extent to which specific memory phenotypic categories of CD8+ T cells reliably represent their functional attributes remains controversial. Methods: We simultaneously assessed surface phenotype and functionality of HIV-specific CD8+ T cells by multiparametric flow cytometry, measuring five CD8+ T cell functions (CD107a, IFNγ, MIP-1β, TNFα and IL2) and phenotypic markers CCR7, CD45RA, and CD27, in parallel in 24 HIV-infected individuals. Results: Virus-specific responses were contained within all eight phenotypic categories defined using CCR7, CD45RA, and CD27. Phenotypic profiles of HIV-specific cells differed from CEF-specific cells, with HIV-specific cells having higher levels of CD45RA (p = 0.008). Interestingly a large portion of CEF and HIV-specific cells were found within previously undefined phenotypes CCR7+CD27-CD45RA+ (14.6% and 17.2%, respectively) and CCR7+CD27-CD45RA-(14.8% and 15.8%, respectively). In addition, up to 10% - 20% of responding cells were phenotypically “naive”. Additionally, memory phenotypes of cells exhibiting monofunctional and polyfunctional responses frequently differed, and failed to associate with a consistent phenotype representing functionally active cells. Conclusion: These data suggest that particularly after antigen stimulation, that surface phenotypes defined by CCR7, CD27 and CD45RA expression on antigen-specific CD8+ T cells, reflect a wide range of immunological functions, and that no single phenotype defined by memory marker expression can reliably be used to identify functional capacity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,089
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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