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Enregistrement W2031857756 · doi:10.1074/jbc.m303977200

Protein Profiling with Epstein-Barr Nuclear Antigen-1 Reveals an Interaction with the Herpesvirus-associated Ubiquitin-specific Protease HAUSP/USP7

2003· article· en· W2031857756 sur OpenAlexaff
Melissa N. Holowaty, Mahel Zeghouf, Hong Wu, Judy Tellam, Vicki Athanasopoulos, Jack Greenblatt, Lori Frappier

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral-associated cancers and disorders
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTandem affinity purificationBiologyProtein arginine methyltransferase 5VirusViral replicationEpstein–Barr virusUbiquitinCell biologyProteaseMolecular biologyVirologyAffinity chromatographyGeneGeneticsMethylationBiochemistryMethyltransferaseEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Epstein-Barr nuclear antigen-1 (EBNA1) protein of Epstein-Barr virus is important for the replication, segregation, and transcriptional activation of latent Epstein-Barr virus genomes; has been implicated in host cell immortalization; and avoids proteasomal processing and cell-surface presentation. To gain insight into how EBNA1 fulfills these functions, we have profiled cellular protein interactions with EBNA1 using EBNA1 affinity chromatography and tandem affinity purification (TAP) of EBNA1 complexes from human cells (TAP-tagging). We discovered several new specific cellular protein interactions with EBNA1, including interactions with HAUSP/USP7, NAP1, template-activating factor-I beta/SET, CK2, and PRMT5, all of which play important cell regulatory roles. The ubiquitin-specific protease USP7 is a known target of herpes simplex virus, and the USP7-binding region of EBNA1 was mapped to amino acids 395-450. A mutation in EBNA1 that selectively disrupted binding to USP7 was found to cause a 4-fold increase in EBNA1 replication activity but had no effect on EBNA1 turnover and cell-surface presentation. The results suggest that USP7 can regulate the replication function of EBNA1 and that EBNA1 may influence cellular events by sequestering key regulatory proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,052
Score d'incertitude au seuil0,498

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations227
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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