Protein Profiling with Epstein-Barr Nuclear Antigen-1 Reveals an Interaction with the Herpesvirus-associated Ubiquitin-specific Protease HAUSP/USP7
Notice bibliographique
Résumé
The Epstein-Barr nuclear antigen-1 (EBNA1) protein of Epstein-Barr virus is important for the replication, segregation, and transcriptional activation of latent Epstein-Barr virus genomes; has been implicated in host cell immortalization; and avoids proteasomal processing and cell-surface presentation. To gain insight into how EBNA1 fulfills these functions, we have profiled cellular protein interactions with EBNA1 using EBNA1 affinity chromatography and tandem affinity purification (TAP) of EBNA1 complexes from human cells (TAP-tagging). We discovered several new specific cellular protein interactions with EBNA1, including interactions with HAUSP/USP7, NAP1, template-activating factor-I beta/SET, CK2, and PRMT5, all of which play important cell regulatory roles. The ubiquitin-specific protease USP7 is a known target of herpes simplex virus, and the USP7-binding region of EBNA1 was mapped to amino acids 395-450. A mutation in EBNA1 that selectively disrupted binding to USP7 was found to cause a 4-fold increase in EBNA1 replication activity but had no effect on EBNA1 turnover and cell-surface presentation. The results suggest that USP7 can regulate the replication function of EBNA1 and that EBNA1 may influence cellular events by sequestering key regulatory proteins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».