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Enregistrement W2032251637 · doi:10.1080/07060660509507262

Asymptomatic infection, and distribution of<i>Ophiostoma mitovirus 3a</i>(OMV3a), in populations of<i>Sclerotinia homoeocarpa</i>

2005· article· en· W2032251637 sur OpenAlexafffundvenueabout
M.S. Melzer, F. Deng, G. J. Boland

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant and Fungal Interactions Research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésVirulenceBiologyOphiostomaVirologyPolymerase chain reactionMicrobiologyPathogenVirusAsymptomaticFungusGeneticsBotanyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

One hundred and sixteen isolates of Sclerotinia homoeocarpa from nine locations in southwestern Ontario and one location in Nova Scotia were assessed for the presence of a hypovirulence-associated mitovirus, Ophiostoma mitovirus 3a (OMV3a). Two detection methods, nucleic acid extraction with gel electrophoresis (NAE–GE) and reverse transcription – polymerase chain reaction (RT–PCR), were employed. Phenotype, growth rate, and virulence of isolates were also assessed. OMV3a was detected in four isolates (3.4%), using both the standard NAE–GE method and the RT–PCR method. The four isolates displayed reduced colony growth and virulence, and they were considered to be symptomatic, hypovirulent isolates infected by OMV3a. In the remaining 112 isolates, OMV3a was detected in 53 isolates by RT–PCR only. These isolates displayed typical colony growth and virulence, and they were considered to have asymptomatic infections by the virus. OMV3a was not detected by either method in 59 isolates that displayed typical colony growth and virulence; these isolates were considered to be free of infection by the virus. OMV3a was detected from 8 of 10 locations, all in Ontario, and in 17% to 100% of S. homoeocarpa isolates at these locations. Vegetative compatibility groups (VCGs) were previously determined for these isolates, and OMV3a was detected in 66%, 54%, and 19% of the isolates from VCGs B, A, and G, respectively, which were the three most prevalent. The results demonstrated that OMV3a was present in isolates with and without the characteristic symptoms of hypovirulence and that it was widely distributed in southwestern Ontario and in isolates from the three most prevalent VCGs detected among these isolates. This is the first report of widespread asymptomatic infections by a hypovirulence-related virus in populations of a fungal plant pathogen.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,407
Score d'incertitude au seuil0,977

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2005
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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