Asymptomatic infection, and distribution of<i>Ophiostoma mitovirus 3a</i>(OMV3a), in populations of<i>Sclerotinia homoeocarpa</i>
Notice bibliographique
Résumé
One hundred and sixteen isolates of Sclerotinia homoeocarpa from nine locations in southwestern Ontario and one location in Nova Scotia were assessed for the presence of a hypovirulence-associated mitovirus, Ophiostoma mitovirus 3a (OMV3a). Two detection methods, nucleic acid extraction with gel electrophoresis (NAE–GE) and reverse transcription – polymerase chain reaction (RT–PCR), were employed. Phenotype, growth rate, and virulence of isolates were also assessed. OMV3a was detected in four isolates (3.4%), using both the standard NAE–GE method and the RT–PCR method. The four isolates displayed reduced colony growth and virulence, and they were considered to be symptomatic, hypovirulent isolates infected by OMV3a. In the remaining 112 isolates, OMV3a was detected in 53 isolates by RT–PCR only. These isolates displayed typical colony growth and virulence, and they were considered to have asymptomatic infections by the virus. OMV3a was not detected by either method in 59 isolates that displayed typical colony growth and virulence; these isolates were considered to be free of infection by the virus. OMV3a was detected from 8 of 10 locations, all in Ontario, and in 17% to 100% of S. homoeocarpa isolates at these locations. Vegetative compatibility groups (VCGs) were previously determined for these isolates, and OMV3a was detected in 66%, 54%, and 19% of the isolates from VCGs B, A, and G, respectively, which were the three most prevalent. The results demonstrated that OMV3a was present in isolates with and without the characteristic symptoms of hypovirulence and that it was widely distributed in southwestern Ontario and in isolates from the three most prevalent VCGs detected among these isolates. This is the first report of widespread asymptomatic infections by a hypovirulence-related virus in populations of a fungal plant pathogen.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».