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Enregistrement W2032278379 · doi:10.1021/bi801328u

Regulation of Sterol Transport between Membranes and NPC2

2008· article· en· W2032278379 sur OpenAlexfundno aff
Zhi Xu, William Farver, Sarala Kodukula, Judith Storch

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Research Council Canada
Mots-clésSterolMembraneChemistryBiochemistryBiophysicsCell biologyCholesterolBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Niemann-Pick disease type C (NPC) is caused by defects in either the NPC1 or NPC2 gene and is characterized by accumulation of cholesterol and glycolipids in the late endosome/lysosome compartment. NPC2 is an intralysosomal protein that binds cholesterol in vitro. Previous studies demonstrated rapid rates of cholesterol transfer from NPC2 to model membranes [Cheruku, S. R., et al. (2006) J. Biol. Chem. 281, 31594-31604]. To model the potential role of NPC2 as a lysosomal cholesterol export protein, in this study we used fluorescence spectroscopic approaches to examine cholesterol transfer from membranes to NPC2, assessing the rate, mechanism, and regulation of this transport step. In addition, we examined the effect of NPC2 on the rate and kinetic mechanism of intermembrane sterol transport, to model the movement of cholesterol from internal lysosomal membranes to the limiting lysosomal membrane. The results support the hypothesis that NPC2 plays an important role in endo/lysosomal cholesterol trafficking by markedly accelerating the rates of cholesterol transport. Rates of sterol transfer from and between membranes were increased by as much as 2 orders of magnitude by NPC2. The transfer studies indicate that the mechanism of NPC2 action involves direct interaction of the protein with membranes. Such interactions were observed directly using FTIR spectroscopy and protein tryptophan spectral shifts. Additionally, cholesterol transfer by NPC2 was found to be greatly enhanced by the unique lysosomal phospholipid lyso-bisphosphatidic acid (LBPA), suggesting an important role for LBPA in NPC2-mediated cholesterol trafficking.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations97
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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