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Enregistrement W2032441014 · doi:10.1080/07060660809507501

Genetic variation and identification of molecular markers associated with partial resistance to<i>Phoma macdonaldii</i>in gamma-irradiation-induced mutants of sunflower

2008· article· en· W2032441014 sur OpenAlexvenueno aff
Reza Darvishzadeh, S. Poormohammad Kiani, Thierry Huguet, A. Sarrafi

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSunflower and Safflower Cultivation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyAmplified fragment length polymorphismPhomaGeneticsPopulationEpistasisAlleleMolecular markerMutantGenetic markerGeneBotanyGenetic diversity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A study was undertaken to evaluate the genetic variability among gamma-irradiation-induced sunflower mutants for partial resistance to phoma black stem, caused by Phoma macdonaldii, and to identify putative molecular markers associated with partial resistance. A population of 60 mutant lines and the original line AS613 were evaluated with an aggressive French isolate of P. macdonaldii (MP6) under controlled conditions. Mutants with partial resistance to phoma black stem were identified. Variance in partial resistance and molecular markers, generated with 17 amplified fragment length polymorphism (AFLP) primer combinations, were estimated. Genetic analysis revealed that partial resistance in the mutant line M6-54-1 was controlled by recessive gene(s). The F1 hybrid (developed by crossing M6-54-1 with a susceptible inbred ENSAT-B4) was, however, significantly less susceptible than the susceptible parent, indicating that the difference between the F1 hybrid and its parents in reaction to phoma black stem cannot be fully explained by the recessive gene model. Dominance between alleles (epistasis) caused reduced susceptibility in the F1 progeny, which were also clearly reflected in distributions of phenotypic reactions of F2 and backcross seedlings. Generation mean analysis confirmed that epistatic effects contributed significantly to genetic variation in phoma black stem resistance in M6-54-1. Using multiple regression analysis, eight AFLP markers associated with partial resistance to phoma black stem were identified. Predicted reactions of all mutants to the disease based on their marker profiles were not significantly different from the observed values. The same AFLP primer combinations were used to map quantitative trait loci in the F2 population and F3 families, and one AFLP marker (E33M61-11) was found to be tightly linked to phoma black stem susceptibility.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,181
Écart entre enseignants0,169 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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