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Enregistrement W2033019910 · doi:10.5539/jas.v4n12p243

Cloning and Characterization of a NBS-LRR Resistance Gene from Peanut (Arachis hypogaea L.?

2012· article· en· W2033019910 sur OpenAlex
Yixiong Zheng, Chunjuan Li, Yu Liu, Caixia Yan, Tingting Zhang, Weijian Zhuang, Shihua Shan

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueJournal of Agricultural Science · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePeanut Plant Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésGeneBiologyGeneticsArachis hypogaeaComplementary DNAHomology (biology)Plant disease resistanceArachisOpen reading frameR geneGenomeCloning (programming)Molecular biologyPeptide sequenceBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The nucleotide-binding site (NBS)-Leucine-rich repeat (LRR) gene family accounts for the largest number of known disease resistance genes, and is one of the largest gene families in plant genomes. In the present study, based on the NBS domain, resistance gene analogues (RGAs) have been isolated from peanut, which named PnAG3. A full-length cDNA, PnAG3 was obtained by rapid amplification of cDNA ends (RACE) method. Sequence analysis indicated that the length of PnAG3 was 1 882 bp, including a complete open reading frame of 1 335 bp encoding PnAG3 protein of 444 amino acids. Multiple analysis showed that it had a certain homology with known resistance proteins, among which Arachis cardenasii resistance protein had the highest homology (48.01%). The polypeptide has a typical structure of nonTIR-NBS-LRR genes. Real-time fluorescence quantitative PCR analysis showed that after A. flavus infection, the expression of PnAG3 gene in J11 (A. flavus resistance species) has increased 16.68, 11.16 and 25.96 times in seed coat, kernel and pericarp, respectively. But it only increased 2-3 times in JH1012 (A. flavus sensitive species). The cloning of putative resistance gene from peanut provides a basis for studying the structure and function of peanut disease-resistance relating genes and disease resistant genetic breeding in peanut.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,880
Score d'incertitude au seuil0,238

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle