Lentivector-mediated clonal tracking reveals intrinsic heterogeneity in the human hematopoietic stem cell compartment and culture-induced stem cell impairment
Notice bibliographique
Résumé
Knowledge of the composition and interrelationship of the various hematopoietic stem cells (HSCs) that comprise the human HSC pool and the consequence of culture on each class is required for effective therapies based on stem cells. Clonal tracking of retrovirally transduced HSCs in nonobese diabetic/severe combined immunodeficient (NOD/SCID) mice revealed heterogeneity in the repopulation capacity of SCID-repopulating cells (SRCs). However, it is impossible to establish whether HSC heterogeneity is intrinsic or whether the culture conditions required for retroviral transduction induce qualitative and quantitative alterations to SRCs. Here, we report establishment of a clonal tracking method that uses lentivectors to transduce HSCs with minimal manipulation during overnight culture without cytokine stimulation. By serial bone marrow (BM) sampling of mice receiving transplants, short-term SRCs (ST-SRCs) and long-term SRCs (LT-SRCs) were identified on the basis of repopulation dynamics demonstrating that their existence is not an experimental artifact but reflects the state of the HSC pool. However, 4 days of culture in conditions previously used for SRC retroviral transduction significantly reduced SRC number as assessed by clonal analysis. These studies provide a foundation to understand the molecular and cellular determinants of human HSC development and to develop therapies targeted to specific HSC classes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».