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Enregistrement W2034201571 · doi:10.1128/jb.02333-14

Role of the Streptococcus mutans CRISPR-Cas Systems in Immunity and Cell Physiology

2014· article· en· W2034201571 sur OpenAlexafffund
Mihaela Anca Serbanescu, Martha Cordova, Kirsten Krastel, Robert Flick, Natalia Beloglazova, Andrew Latos, Alexander F. Yakunin, Dilani B. Senadheera, Dennis G. Cvitkovitch

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCRISPRBiologyPlasmidStreptococcus mutansCas9Transformation (genetics)VirulenceHeat shockTransduction (biophysics)GeneMicrobiologyGeneticsBacteriaHeat shock proteinBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CRISPR-Cas systems provide adaptive microbial immunity against invading viruses and plasmids. The cariogenic bacterium Streptococcus mutans UA159 has two CRISPR-Cas systems: CRISPR1 (type II-A) and CRISPR2 (type I-C) with several spacers from both CRISPR cassettes matching sequences of phage M102 or genomic sequences of other S. mutans. The deletion of the cas genes of CRISPR1 (ΔC1S), CRISPR2 (ΔC2E), or both CRISPR1+2 (ΔC1SC2E) or the removal of spacers 2 and 3 (ΔCR1SP13E) in S. mutans UA159 did not affect phage sensitivity when challenged with virulent phage M102. Using plasmid transformation experiments, we demonstrated that the CRISPR1-Cas system inhibits transformation of S. mutans by the plasmids matching the spacers 2 and 3. Functional analysis of the cas deletion mutants revealed that in addition to a role in plasmid targeting, both CRISPR systems also contribute to the regulation of bacterial physiology in S. mutans. Compared to wild-type cells, the ΔC1S strain displayed diminished growth under cell membrane and oxidative stress, enhanced growth under low pH, and had reduced survival under heat shock and DNA-damaging conditions, whereas the ΔC2E strain exhibited increased sensitivity to heat shock. Transcriptional analysis revealed that the two-component signal transduction system VicR/K differentially modulates expression of cas genes within CRISPR-Cas systems, suggesting that VicR/K might coordinate the expression of two CRISPR-Cas systems. Collectively, we provide in vivo evidence that the type II-A CRISPR-Cas system of S. mutans may be targeted to manipulate its stress response and to influence the host to control the uptake and dissemination of antibiotic resistance genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,512
Score d'incertitude au seuil0,251

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations71
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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