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Enregistrement W2034328878 · doi:10.3835/plantgenome2009.05.0015

Karyotypic Evolution of the Common and Silverleaf Sunflower Genomes

2009· article· en· W2034328878 sur OpenAlexaff
Adam Heesacker, Eleni Bachlava, Robert L. Brunick, John M. Burke, Loren H. Rieseberg, Steven J. Knapp

Notice bibliographique

RevueThe Plant Genome · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSunflower and Safflower Cultivation
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesGeorgia Research Alliance
Mots-clésBiologySyntenyGeneticsGenomeChromosomal rearrangementHelianthus annuusChromosomeChromosomal translocationGene duplicationKaryotypeGeneSunflower

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Silverleaf sunflower ( Helianthus argophyllus Torrey and Gray) has been an important source of favorable alleles for broadening genetic diversity and enhancing agriculturally important traits in common sunflower ( H. annuus L.), and, as the closest living relative of H. annuus , provides an excellent model for understanding how apparently maladaptive chromosomal rearrangements became established in this genus. The genomes of H. annuus and H. argophyllus were comparatively mapped to identify syntenic and rearranged chromosomes and develop genomic blueprints for predicting the impact of chromosomal rearrangements on interspecific gene flow. Syntenic chromosomal segments were identified and aligned using 131 orthologous DNA marker loci distributed throughout the H. annuus genome (299 DNA marker loci were mapped in H. argophyllus ). We identified 28 colinear chromosomal segments, 10 colinear chromosomes, and seven chromosomal rearrangements (five non‐reciprocal translocations and two inversions). Four H. argophyllus chromosomes carrying non‐reciprocal translocations apparently arose from the duplication of two chromosomes, and three H. argophyllus chromosomes apparently arose from end‐to‐end or end‐to‐opposite‐end fusions of chromosomes or chromosome segments. Chromosome duplication may reduce the initial fitness costs of chromosomal rearrangements, thereby facilitating their establishment. Despite dramatic differences in chromosome architecture, a significant fraction of the H. argophyllus genome appears to be accessible for introgression into H. annuus .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,184
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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