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Enregistrement W2034457721 · doi:10.1371/journal.pone.0097797

Serum Stability and Physicochemical Characterization of a Novel Amphipathic Peptide C6M1 for SiRNA Delivery

2014· article· en· W2034457721 sur OpenAlexafffund
Mousa Jafari, Wen Xu, Pan Ran, Chad M. Sweeting, D. Nedra Karunaratne, Pu Chen

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Interference and Gene Delivery
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research Chairs
Mots-clésSmall interfering RNADynamic light scatteringPeptideCircular dichroismChemistryBiophysicsRandom coilAmphiphileNucleic acidGene knockdownOligonucleotideRNAMolecular biologyBiochemistryRNase PFörster resonance energy transferFluorescenceBiologyMaterials scienceGeneNanotechnologyNanoparticleCopolymerPolymer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The efficient delivery of nucleic acids as therapeutic agents is a major challenge in gene therapy. Peptides have recently emerged as a novel carrier for delivery of drugs and genes. C6M1 is a designed amphipathic peptide with the ability to form stable complexes with short interfering RNA (siRNA). The peptide showed a combination of random coil and helical structure in water but mainly adopted a helical conformation in the presence of anions or siRNA. Revealed by dynamic light scattering (DLS) and microscopy techniques, the interaction of C6M1 and siRNA in water and HEPES led to complexes of ∼70 and ∼155 nm in size, respectively, but showed aggregates as large as ∼500 nm in PBS. The time-dependent aggregation of the complex in PBS was studied by DLS and fluorescence spectroscopy. At molar ratio of 15∶1, C6M1 was able to completely encapsulate siRNA; however, higher molar ratios were required to obtain stable complexes. Naked siRNA was completely degraded in 4 h in the solution of 50% serum; however C6M1 protected siRNA against serum RNase over the period of 24 h. Western blotting experiment showed ∼72% decrease in GAPDH protein level of the cells treated with C6M1-siRNA complexes while no significant knockdown was observed for the cells treated with naked siRNA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,371

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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