Transient Kinetic Studies of Heme Reduction in <i>Escherichia coli</i> Nitrate Reductase A (NarGHI) by Menaquinol
Notice bibliographique
Résumé
We have studied the transient kinetics of quinol-dependent heme reduction in Escherichia coli nitrate reductase A (NarGHI) by the menaquinol analogue menadiol using the stopped-flow method. Four kinetic phases are observed in the reduction of the hemes. A transient species, likely to be associated with a semiquinone radical anion, is observed with kinetics that correlates with one of the phases. The decay of the transient species and the formation of the second reduction phase of the hemes can be fitted to a double-exponential equation giving similar rate constants, k(1) = 9.24 +/- 0.9 s(-1) and k(2) = 0.22 +/- 0.02 s(-1) for the decay of the transient species, and k(1) = 9.23 +/- 0.9 s(-1) and k(2) = 0.22 +/- 0.02 s(-1) for the formation of the reduction phase. The quinol-binding-site inhibitors 2-n-heptyl-4-hydroxyquinoline-N-oxide (HOQNO) and stigmatellin have significant and different inhibitory effects on the reduction kinetics. The kinetics of heme reduction in NarI expressed in the absence of the NarGH catalytic dimer (NarI(DeltaGH) exhibits only two kinetic phases, and the decay of the transient species also correlates kinetically with the second reduction phase of the hemes. We have also studied nitrate-dependent heme reoxidation following quinol-dependent heme reduction using a sequential stopped-flow method. HOQNO elicits a much stronger inhibitory effect than stigmatellin on the reoxidation of the hemes. On the basis of our results, we propose schemes for the mechanism of NarGHI reduction by menaquinol and reoxidation by nitrate.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».