Density Functional Theory Analysis of Stereoelectronic Properties of Cobalamins
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Notice bibliographique
Résumé
Density functional theory (DFT) is applied to the calculation of the steric and electronic factors which might affect the Co−C R bond activation in coenzyme B 12 . The six-coordinate cobalamins (B−[Co III (corrin)]−R, models of coenzyme B 12 ) include the actual corrin macroring as the equatorial ligand and imidazole (Im), dimethylbenzimidazole (DBI) or water (H 2 O), as the α-trans ligand (B). The β axial ligand (R) represents a series of alkyl groups with different steric bulkiness ranging from −C⋮N, −C⋮CH through methyl, ethyl, isopropyl, tert -butyl to 5‘-deoxy-5‘-adenosyl. Each trans ligand (Im, DBI or H 2 O) produces a positive correlation of the Co−C R and Co−N B bond lengths. The increasing complexity of the R group leads to two major structural correlations: a positive correlation between the Co−C R and Co−N B bond lengths and an inverse correlation between the Co−C R bond length and the flatness of the corrin ring. It is shown that stereoelectronic properties of cobalamins can only be explained on the basis of electronic considerations. Moreover, electron donation from axial ligands to the cobalt atom either by electron donating substituents or by a properly oriented external electric field caused by external electric charges is argued to be the main trigger for the activation of the Co−C R bond.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle