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Enregistrement W2034590859 · doi:10.1099/mic.0.073452-0

Quantitative evaluation of the host-colonizing capabilities of the enteric bacterium Pantoea using plant and insect hosts

2014· article· en· W2034590859 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMicrobiology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogenic Bacteria Studies
Établissements canadiensUniversity of Regina
Organismes subventionnairesUniversity of Regina
Mots-clésBiologyPantoeaHost (biology)Housekeeping genePathogenic bacteriaPhylogenetic treeInsectIsolation (microbiology)Pantoea agglomeransPhylogeneticsMicrobiologyBacteriaHuman pathogenGeneZoologyEcology16S ribosomal RNAGeneticsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The genus Pantoea is a highly diverse group comprising free-living, and both pathogenic and non-pathogenic host-associating species. Pathogenic isolates have been found to infect insects, plants and humans, yet it is unclear whether these isolates have similar pathogenic potential to the free-living environmental populations. Using MLSA of six housekeeping genes, we evaluated the phylogenetic relationships among 115 environmental and clinical (human) isolates representing 11 Pantoea species. An overlay of the location of isolation onto the resulting tree revealed that clinical and environmental isolates are interspersed, and do not form distinctive groups. We then conducted quantitative growth assays of our isolates using maize, onion and fruit flies as hosts. Notably, most clinical isolates were able to grow in both plant hosts often comparably or even better than the environmental isolates. There were no obvious growth or host colonization patterns that could distinguish those isolates with clinical potential. Growth of an isolate in one host could not be predicted based on its performance in another host, nor could host growth be predicted by phylogeny or source of isolation. This work demonstrates that the host-colonizing capabilities of all Pantoea species groups is unpredictable, indicating a broader host range and pathogenic potential than currently assumed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,841
Score d'incertitude au seuil0,120

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle