Quantitative evaluation of the host-colonizing capabilities of the enteric bacterium Pantoea using plant and insect hosts
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
The genus Pantoea is a highly diverse group comprising free-living, and both pathogenic and non-pathogenic host-associating species. Pathogenic isolates have been found to infect insects, plants and humans, yet it is unclear whether these isolates have similar pathogenic potential to the free-living environmental populations. Using MLSA of six housekeeping genes, we evaluated the phylogenetic relationships among 115 environmental and clinical (human) isolates representing 11 Pantoea species. An overlay of the location of isolation onto the resulting tree revealed that clinical and environmental isolates are interspersed, and do not form distinctive groups. We then conducted quantitative growth assays of our isolates using maize, onion and fruit flies as hosts. Notably, most clinical isolates were able to grow in both plant hosts often comparably or even better than the environmental isolates. There were no obvious growth or host colonization patterns that could distinguish those isolates with clinical potential. Growth of an isolate in one host could not be predicted based on its performance in another host, nor could host growth be predicted by phylogeny or source of isolation. This work demonstrates that the host-colonizing capabilities of all Pantoea species groups is unpredictable, indicating a broader host range and pathogenic potential than currently assumed.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle