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Enregistrement W2034595206 · doi:10.1002/ijc.20830

Tissue inhibitor of metalloproteinase‐3 (<i>TIMP‐3</i>) gene is methylated in the development of esophageal adenocarcinoma: Loss of expression correlates with poor prognosis

2005· article· en· W2034595206 sur OpenAlexaff
S. Jane Darnton, Laura J. Hardie, R. Muc, Christopher P. Wild, Alan G. Casson

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Cancer · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensQueen Elizabeth II Health Sciences CentreDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMethylationTissue inhibitor of metalloproteinaseBiologyAdenocarcinomaCancer researchTIMP1PathologyDNA methylationCell cultureImmunohistochemistryMetastasisGene expressionExtracellular matrixGeneCancerMedicineImmunologyCell biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Amongst involvement in diverse physiological and pathological processes, TIMP-3 may have an important role in tumour development, growth and metastasis by interaction with metalloproteases in the extracellular matrix. We studied the role and prognostic effect of TIMP-3 in esophageal adenocarcinoma (EADC). TIMP-3 gene methylation and TIMP-3 mRNA expression were analysed in 5 esophageal cell lines and 24 resected EADCs. TIMP-3 protein expression was examined in the 5 cell lines and 79 resected EADCs with known clinicopathological features. TIMP-3 methylation signal was only detected in the OE33 EADC cell line. In tissues, 0% of case-matched normal, 72% of BE and 90% of EADC were positive for methylation. TIMP-3 mRNA was detected in all the cell lines and normal, metaplastic and tumour tissues. TIMP-3 protein was localised to the cytoplasm in cell lines and tissues. Demethylating treatment of OE33 increased protein expression. At the invading edge of tumours, protein staining was equal to, or reduced, compared to normal tissues. Reduction of protein expression was associated with disease stage (p = 0.046) and poor patient survival (OR 2.1, 95% CI 1.2-3.5, p = 0.007). Mean survival time was halved in patients with reduced tumour TIMP-3 expression, from 49 to 24 months. These studies have demonstrated association between methylation of the TIMP-3 gene and BE and EADC. Reduced expression of TIMP-3 protein in EADC is associated with increased tumour invasiveness and reduced patient survival.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,319

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations70
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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