Tissue inhibitor of metalloproteinase‐3 (<i>TIMP‐3</i>) gene is methylated in the development of esophageal adenocarcinoma: Loss of expression correlates with poor prognosis
Notice bibliographique
Résumé
Amongst involvement in diverse physiological and pathological processes, TIMP-3 may have an important role in tumour development, growth and metastasis by interaction with metalloproteases in the extracellular matrix. We studied the role and prognostic effect of TIMP-3 in esophageal adenocarcinoma (EADC). TIMP-3 gene methylation and TIMP-3 mRNA expression were analysed in 5 esophageal cell lines and 24 resected EADCs. TIMP-3 protein expression was examined in the 5 cell lines and 79 resected EADCs with known clinicopathological features. TIMP-3 methylation signal was only detected in the OE33 EADC cell line. In tissues, 0% of case-matched normal, 72% of BE and 90% of EADC were positive for methylation. TIMP-3 mRNA was detected in all the cell lines and normal, metaplastic and tumour tissues. TIMP-3 protein was localised to the cytoplasm in cell lines and tissues. Demethylating treatment of OE33 increased protein expression. At the invading edge of tumours, protein staining was equal to, or reduced, compared to normal tissues. Reduction of protein expression was associated with disease stage (p = 0.046) and poor patient survival (OR 2.1, 95% CI 1.2-3.5, p = 0.007). Mean survival time was halved in patients with reduced tumour TIMP-3 expression, from 49 to 24 months. These studies have demonstrated association between methylation of the TIMP-3 gene and BE and EADC. Reduced expression of TIMP-3 protein in EADC is associated with increased tumour invasiveness and reduced patient survival.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».