Comparative survey of early embryogenesis of Secernentea (Nematoda), with phylogenetic implications
Notice bibliographique
Résumé
Insight into the evolution of class Secernentea (Nematoda) for the purpose of providing a phylogenetic context for the model Caenorhabditis elegans is being gained from the use of molecular character sets. Such phylogenies provide a framework for mapping the evolution of diversity in some early-development characters for 70 species and 19 families of Secernentea. These characters include (i) whether AB and P1 blastomeres initially develop at the same (synchronous) or different (asynchronous) rates, (ii) whether AB and P1 are initially aligned along the linear axis of the embryo (tandem pattern) or obliquely (rhomboidal pattern), and (iii) whether the founder germ cell, P4, is established early, i.e., by the sixth cleavage, or later. Evolutionary polarity of characters was evaluated through outgroup comparisons. From our data the following inferences are made. The derived character, late establishment of P4, evolved primarily in the ancestor of the monophyletic groups Diplogastrina, Rhabditina, and Panagrolaimidae. Asynchronous development is convergent, defining one clade of Tylenchina as well as Cephalobina, and also arising independently in Aphelenchina. The rhomboidal embryo is ancestral to the tandem-pattern embryo that defines a second clade of Tylenchina. Early-embryo characters are congruent with the polyphyly of Cephalobina and Aphelenchina, as has been demonstrated by molecular phylogenies. Many aspects of early embryogenesis, rather than being highly conserved, evolve at a rate appropriate to defining taxa within Secernentea.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».