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Enregistrement W2034745024 · doi:10.1126/science.1211936

Imaging of <i>Plasmodium</i> Liver Stages to Drive Next-Generation Antimalarial Drug Discovery

2011· article· en· W2034745024 sur OpenAlexfundno aff
Stephan Meister, David Plouffe, Kelli Kuhen, Ghislain M. C. Bonamy, Tao Wu, S. Whitney Barnes, Selina Bopp, Rachel Borboa, A. Taylor Bright, Jianwei Che, Steve Cohen, Neekesh V. Dharia, Kerstin Gagaring, Montip Gettayacamin, Perry Gordon, Todd Groessl, Nobutaka Kato, Lee M, Case W. McNamara, David A. Fidock, A. S. Nagle, Tae‐gyu Nam, Wendy Richmond, Jason Roland, Matthias Rottmann, Bin Zhou, Patrick Froissard, Richard Glynne, Dominique Mazier, Jetsumon Sattabongkot, Peter G. Schultz, Tove Tuntland, John R. Walker, Yingyao Zhou, Arnab K. Chatterjee, Thierry T. Diagana, Elizabeth A. Winzeler

Notice bibliographique

RevueScience · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMalaria Research and Control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthMedicines for Malaria VentureInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleDeutsche ForschungsgemeinschaftYork UniversityWellcome TrustW. M. Keck Foundation
Mots-clésMalariaDrug discoveryDrugPlasmodium (life cycle)BiologyPharmacologyDrug developmentIn vivoComputational biologyParasite hostingImmunologyBioinformaticsBiotechnologyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Most malaria drug development focuses on parasite stages detected in red blood cells, even though, to achieve eradication, next-generation drugs active against both erythrocytic and exo-erythrocytic forms would be preferable. We applied a multifactorial approach to a set of >4000 commercially available compounds with previously demonstrated blood-stage activity (median inhibitory concentration < 1 micromolar) and identified chemical scaffolds with potent activity against both forms. From this screen, we identified an imidazolopiperazine scaffold series that was highly enriched among compounds active against Plasmodium liver stages. The orally bioavailable lead imidazolopiperazine confers complete causal prophylactic protection (15 milligrams/kilogram) in rodent models of malaria and shows potent in vivo blood-stage therapeutic activity. The open-source chemical tools resulting from our effort provide starting points for future drug discovery programs, as well as opportunities for researchers to investigate the biology of exo-erythrocytic forms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations347
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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