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Enregistrement W2035454589 · doi:10.1073/pnas.0811273106

Functional and genetic evidence that the Mal/TIRAP allele variant 180L has been selected by providing protection against septic shock

2009· article· en· W2035454589 sur OpenAlexaff
Bart Ferwerda, Santos Alonso, Kathy Banahan, Matthew B. B. McCall, Evangelos J. Giamarellos‐Bourboulis, Bart Ramakers, Maria Mouktaroudi, Pamela R. Fain, Neskuts Izagirre, Din Syafruddin, Tudor Cristea, Frank P. Mockenhaupt, Marita Troye‐Blomberg, Oliver Kumpf, Boubacar Maïga, Amagana Dolo, Ogobara K. Doumbo, Santhosh Sundaresan, George Bedu‐Addo, Reinout van Crevel, Lutz Hamann, Djin‐Ye Oh, Ralf R. Schumann, Leo A. B. Joosten, Concepción de la Rúa Vaca, Robert W. Sauerwein, Joost P.H. Drenth, Bart Jan Kullberg, André van der Ven, Adrian V. S. Hill, Peter Pickkers, Jos W.M. van der Meer, Luke O'neill, Mihai G. Netea

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesEuropean Social FundNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekEusko JaurlaritzaEuskal Herriko UnibertsitateaScience Foundation IrelandUniversity of Oxford
Mots-clésBiologyImmunologyInnate immune systemAlleleTLR2TLR9TLR4Proinflammatory cytokineSepsisGeneticsImmune systemGeneInflammation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Adequate responses by our innate immune system toward invading pathogens were of vital importance for surviving infections, especially before the antibiotic era. Recently, a polymorphism in Mal (Ser180Leu, TIRAP rs8177374), an important adaptor protein downstream of the Toll-like receptor (TLR) 2 and 4 pathways, has been described to provide protection against a broad range of infectious pathogens. We assessed the functional effects of this polymorphism in human experimental endotoxemia, and we demonstrate that individuals bearing the TIRAP 180L allele display an increased, innate immune response to TLR4 and TLR2 ligands, but not to TLR9 stimulation. This phenotype has been related to an increased resistance to infection. However, an overshoot in the release of proinflammatory cytokines by TIRAP 180L homozygous individuals suggests a scenario of balanced evolution. We have also investigated the worldwide distribution of the Ser180Leu polymorphism in 14 populations around the globe to correlate the genetic makeup of TIRAP with the local infectious pressures. Based on the immunological, clinical, and genetic data, we propose that this mutation might have been selected in West Eurasia during the early settlement of this region after the out-of-Africa migration of modern Homo sapiens. This combination of functional and genetic data provides unique insights to our understanding of the pathogenesis of sepsis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,179
Score d'incertitude au seuil0,513

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations90
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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