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Enregistrement W2035555871 · doi:10.1074/jbc.m307388200

A Highly Conserved NTRK3 C-terminal Sequence in the ETV6-NTRK3 Oncoprotein Binds the Phosphotyrosine Binding Domain of Insulin Receptor Substrate-1

2004· article· en· W2035555871 sur OpenAlexaff
Chris L. Lannon, Matthew J. Martin, Cristina E. Tognon, Wook Jin, Seong‐Jin Kim, Poul H. Sorensen

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism, Diabetes, and Cancer
Établissements canadiensChildren's & Women's Health Centre of British ColumbiaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTerminal (telecommunication)Cell biologyChemistryInsulin receptorSubstrate (aquarium)Domain (mathematical analysis)C-terminusSequence (biology)Binding siteReceptorBiologyInsulinMolecular biologyBiochemistryComputer scienceAmino acidEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Receptor tyrosine kinases are integral components of cellular signaling pathways and are frequently deregulated in malignancies. The NTRK family of neurotrophin receptors mediate neuronal cell survival and differentiation, but altered NTRK signaling has also been implicated in oncogenesis. The ETV6-NTRK3 (EN) gene fusion occurs in human pediatric spindle cell sarcomas and secretory breast carcinoma, and encodes the oligomerization domain of the ETV6 transcription factor fused to the protein-tyrosine kinase domain of NTRK3. The EN protein functions as a constitutively active protein-tyrosine kinase with potent transforming activity in multiple cell lineages, and EN constitutively activates both the Ras-MAPK and phosphatidylinositol 3-kinase-Akt pathways. EN transformation is associated with constitutive tyrosine phosphorylation of insulin receptor substrate-1 (IRS-1). Further, IRS-1 functions as the adaptor protein linking EN to downstream signaling pathways. However, the exact nature of the EN-IRS-1 interaction remains unknown. We now demonstrate that EN specifically binds the phosphotyrosine binding domain of IRS-1 via an interaction at the C terminus of EN. An EN mutant lacking the C-terminal 19 amino acids does not bind IRS-1 and lacks transforming ability. Moreover, expression of an IRS-1 polypeptide containing the phosphotyrosine binding domain acts in a dominant negative manner to inhibit EN transformation, and overexpression of IRS-1 potentiates EN transforming activity. These findings indicate that EN.IRS-1 complex formation through the NTRK3 C terminus is essential for EN transformation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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