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Enregistrement W2036426926 · doi:10.1002/ajmg.a.33918

Discordant phenotypes in a mother and daughter with mosaic supernumerary ring chromosome 19 explained by a de novo 7q36.2 deletion and 7p22.1 duplication

2011· article· en· W2036426926 sur OpenAlexaff
Bob Argiropoulos, Melissa Carter, Kathy Brierley, Heather Hare, Amélie Bouchard, Walla Al‐Hertani, Shannon Ryan, Judith Reid, Mark Basik, Jean McGowan‐Jordan, Gail E. Graham

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensMcGill University Health CentreHospital for Sick ChildrenUniversity of OttawaSudbury Regional HospitalHolland Bloorview Kids Rehabilitation HospitalSickKids FoundationChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChromosomal inversionGeneticsMicrocephalyBiologyRing chromosomeSupernumerarySmall supernumerary marker chromosomeKaryotypeGene duplicationShort statureChromosome 7 (human)Chromosome 16Chromosome 21MonosomyChromosomeGeneAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We report on a patient with severe intellectual disability, microcephaly, short stature, and dysmorphic features who, based on standard karyotyping, has two cytogenetic abnormalities: an apparently balanced paracentric inversion of chromosome 7, inv(7)(q31.2q36), and a small supernumerary ring chromosome derived entirely of material from chromosome 19. While the inversion was detected in all cells, mosaicism was observed for the ring chromosome. Interestingly, apparently identical cytogenetic abnormalities were detected in the patient's mother, who presented with normal stature, few dysmorphic features, and normal cognition without microcephaly. While the level of mosaicism could not adequately explain the phenotypic discordance, comparative genome hybridization revealed a de novo terminal deletion of chromosome 7, del(7)(q36.2), and a terminal duplication of chromosome 7, dup(7)(p22.1) in the patient. Additional cytogenetic investigation revealed that the patient inherited a recombinant chromosome derived from a cryptic maternal pericentric inversion: inv(7)(p22q36). The patient's distinctive features are consistent with the wide phenotypic spectrum reported in 7p duplication and 7q terminal deletion syndromes. These chromosomal regions contain several candidate genes of clinical significance, including SHH, EN2, and FAM20C. Our findings strongly suggest that our patient's phenotype is largely attributable to partial 7pter trisomy and partial 7qter monosomy rather than mosaic supernumerary ring chromosome 19.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,088
Score d'incertitude au seuil0,352

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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