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Enregistrement W2037168660 · doi:10.4319/lom.2006.4.406

A system to quantitatively recover bacterioplankton respiratory CO<sub>2</sub>for isotopic analysis to trace sources and ages of organic matter consumed in freshwaters

2006· article· en· W2037168660 sur OpenAlexaff
S. Leigh McCallister, François Guillemette, Paul A. del Giorgio

Notice bibliographique

RevueLimnology and Oceanography Methods · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal ecosystems
Établissements canadiensUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesLawrence Livermore National Laboratory
Mots-clésEnvironmental chemistryBacterioplanktonChemistryDissolved organic carbonCarbonateOrganic matterIncubationCarbon fibersTotal inorganic carbonCarbon dioxidePhytoplanktonNutrient

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We present a new system and method to measure the natural abundance isotopic (δ13C, Δ14C) values of respiratory CO2 produced by bacterioplankton, to directly assess the sources and ages of organic carbon (OC) respired by bacteria in aquatic ecosystems. The Respiratory Carbon Recovery System (ReCReS) and operating procedure were designed to reduce background dissolved inorganic carbon values by > 98% and then quantitatively recover the CO2 derived from bacterial respiration after incubation of freshwater samples. The 2-component ReCReS consists of an airtight incubation system (20 L), for short-term regrowth incubations of filtered water samples inoculated with ambient bacteria, and a harvest system to recover the respiratory CO2 produced during these incubations. The multistep operating procedure involves the following: (1) filling of incubation system with 0.2-µm filtered sample water; (2) addition of 1 N HCl (pH to ~2.8); (3) sparge with ultrahigh-purity (UHP) He to remove dissolved inorganic carbon; (4) sparge with UHP, volatile organic carbon-, CO2-free air to replenish oxygen; (5) neutralization (1 N carbonate free NaOH), reinoculation with the ambient bacterial assemblage, and incubation (80-132 h); (6) acidification to pH 2.8; and (7) UHP He sparge for > 12 h. The evolved CO2 is sent through 2 water traps (dry ice slurries) before cryogenic trapping in liquid N2. Control incubations were processed concurrently to evaluate extraction efficiencies, potential methodological contamination, and fractionation artifacts. Collectively, our results suggest that respiratory CO2 is quantitatively recovered and the isotopic fidelity (δ13C, Δ14C) between the OC respired and the CO2 harvested is retained. Moreover, the system allows the recovery of sufficient C to measure both δ13C and Δ14C values, even in the most oligotrophic systems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,920

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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