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Enregistrement W2037217535 · doi:10.1021/ja809258y

Helical Structure of Disodium 5′-Guanosine Monophosphate Self-Assembly in Neutral Solution

2009· article· en· W2037217535 sur OpenAlexaff
Gang Wu, Irene C. M. Kwan

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhosphodiester bondChemistryNucleic acidGuanosinePolynucleotideNucleotideDNACovalent bondHelix (gastropod)RNAStereochemistryHydrogen bondMoleculeCrystallographyBiochemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nucleic acid molecules (DNA and RNA) are formed by linking many different basic units known as nucleotides together via covalent phosphodiester bonds. Nucleic acid molecules often form helical structures known as B-DNA (right-handed), A-DNA/RNA (right-handed), and Z-DNA (left-handed). We have found that spontaneous self-assembly of just one nucleotide, guanosine 5'-monophosphate (5'-GMP), leads to formation of a right-handed helix in neutral solution. The linkage between individual 5'-GMP molecules along the helix is provided by hydrogen bonds, as opposed to the covalent phosphodiester bonds found in regular polynucleotides. The most surprising finding is that this right-handed 5'-GMP helix has alternating C2'-endo and C3'-endo sugar puckers along the helical strand, a situation only seen to date in left-handed Z-DNA. The self-organized structure of 5'-GMP provides a perfect condition for phosphodiester bond formation which may provide a clue for formation of RNA oligomers under prebiotic conditions. We anticipate that similar helical structures could exist in other nucleic acid systems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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