Expression of <i>cgmpg2</i>, an Endopolygalacturonase Gene of <i>Colletotrichum gloeosporioides</i> f. sp. <i>malvae</i>, in Culture and during Infection of <i>Malva pusilla</i>
Notice bibliographique
Résumé
Abstract A novel polygalacturonase gene was found in the plant pathogenic fungus, Colletotrichum gloeosporioides f. sp. malvae, which causes anthracnose disease of round‐leaved mallow (Malva pusilla). Sequence comparisons showed that this gene, cgmpg2, is highly similar to clgpg2, which was previously described from C. lindemuthianum. In culture, expression of cgmpg2 was observed by reverse transcriptase (RT)‐polymeraase chain reaction (PCR) with mallow cell wall extract as a sole carbon source and a starting pH of 3.5, but not with this substrate at a starting pH of 7.5 or in media with pectin or glucose as sole carbon sources. The expression of cgmpg2 during infection of mallow leaves was compared with the constitutively expressed actin gene, actA, of C. gloeosporioides f. sp. malvae by co‐amplification in RT‐PCR. Expression of cgmpg2 was detected in both the biotrophic and necrotrophic phases of infection with the highest expression levels at the early part of the necrotrophic phase.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».