Evidence of marked glycogen variations in the characteristic Raman signatures of human embryonic stem cells
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Human embryonic stem cells (hESCs) have typical Raman signatures, but specific factors that contribute to variations in these signatures have not been reported to date. Furthermore, variations due to the passaging that is necessary for hESC culture maintenance could potentially distort these signatures. It is therefore important to characterize the impact of these culture manipulations on the Raman spectra to gain a better understanding of the origins and nature of their variations. Here we report on the Raman microspectroscopy of hESCs samples from maintenance cultures, complemented with periodic acid Schiff (PAS, carbohydrates) and 4′‐6‐diamidino‐2‐phenlyindol (DAPI, nuclei) staining. The component predominantly responsible for variations between spectra was spectrally identified as glycogen. Variations in the Raman map of the 480 cm−1 glycogen marker band corresponded with those of a PAS stain of the same sample area. The 785‐nm Raman microspectra of hESC cultures examined daily after passaging showed that the same nonrandom spectral variances occurred at all time points after passaging. The pattern of these variances was identified as being due to glycogen spectral components. Our results help validate the previously observed spectral signatures of hESCs and further delineate and characterize the variations that can be expected in these signatures under normal maintenance culture conditions, and aid distinguishing them from those corresponding to differentiation, thus providing a benchmark for future studies. Copyright © 2010 John Wiley & Sons, Ltd.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».