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Enregistrement W2037635815 · doi:10.1128/jb.00823-08

<i>Escherichia coli</i>Harboring a Natural IncF Conjugative F Plasmid Develops Complex Mature Biofilms by Stimulating Synthesis of Colanic Acid and Curli

2008· article· en· W2037635815 sur OpenAlexfundno aff
Thithiwat May, Satoshi Okabe

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitut National des Sciences Appliquées de LyonVlaamse regeringKarl-Franzens-Universität GrazVlaams Instituut voor BiotechnologieInstitute of GeneticsIndian National Science Academy
Mots-clésBiofilmPilusPlasmidBiologyrpoSEscherichia coliFimbriaMicrobiologyGeneCell biologyBacteriaGeneticsPromoterGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It has been shown that Escherichia coli harboring the derepressed IncFI and IncFII conjugative F plasmids form complex mature biofilms by using their F-pilus connections, whereas a plasmid-free strain forms only patchy biofilms. Therefore, in this study we investigated the contribution of a natural IncF conjugative F plasmid to the formation of E. coli biofilms. Unlike the presence of a derepressed F plasmid, the presence of a natural IncF F plasmid promoted biofilm formation by generating the cell-to-cell mating F pili between pairs of F(+) cells (approximately two to four pili per cell) and by stimulating the formation of colanic acid and curli meshwork. Formation of colanic acid and curli was required after the initial deposition of F-pilus connections to generate a three-dimensional mushroom-type biofilm. In addition, we demonstrated that the conjugative factor of F plasmid, rather than a pilus synthesis function, was involved in curli production during biofilm formation, which promoted cell-surface interactions. Curli played an important role in the maturation process. Microarray experiments were performed to identify the genes involved in curli biosynthesis and regulation. The results suggested that a natural F plasmid was more likely an external activator that indirectly promoted curli production via bacterial regulatory systems (the EnvZ/OmpR two-component regulators and the RpoS and HN-S global regulators). These data provided new insights into the role of a natural F plasmid during the development of E. coli biofilms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,056
Score d'incertitude au seuil0,777

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations82
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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