MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2037695150 · doi:10.1371/journal.pone.0082076

Initial Cell Seeding Density Influences Pancreatic Endocrine Development During in vitro Differentiation of Human Embryonic Stem Cells

2013· article· en· W2037695150 sur OpenAlexafffund
Blair K. Gage, Travis D. Webber, Timothy J. Kieffer

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of British ColumbiaMichael Smith Health Research BCStem Cell Network
Mots-clésPDX1BiologyProgenitor cellPAX4Stem cellEmbryonic stem cellCellular differentiationEnteroendocrine cellCell biologyInternal medicineEndocrinologyEndocrine systemInsulinHormoneMedicineIsletGene expressionBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human embryonic stem cells (hESCs) have the ability to form cells derived from all three germ layers, and as such have received significant attention as a possible source for insulin-secreting pancreatic beta-cells for diabetes treatment. While considerable advances have been made in generating hESC-derived insulin-producing cells, to date in vitro-derived glucose-responsive beta-cells have remained an elusive goal. With the objective of increasing the in vitro formation of pancreatic endocrine cells, we examined the effect of varying initial cell seeding density from 1.3 x 10(4) cells/cm(2) to 5.3 x 10(4) cells/cm(2) followed by a 21-day pancreatic endocrine differentiation protocol. Low density-seeded cells were found to be biased toward the G2/M phases of the cell cycle and failed to efficiently differentiate into SOX17-CXCR4 co-positive definitive endoderm cells leaving increased numbers of OCT4 positive cells in day 4 cultures. Moderate density cultures effectively formed definitive endoderm and progressed to express PDX1 in approximately 20% of the culture. High density cultures contained approximately double the numbers of PDX1 positive pancreatic progenitor cells and also showed increased expression of MNX1, PTF1a, NGN3, ARX, and PAX4 compared to cultures seeded at moderate density. The cultures seeded at high density displayed increased formation of polyhormonal pancreatic endocrine cell populations co-expressing insulin, glucagon and somatostatin. The maturation process giving rise to these endocrine cell populations followed the expected cascade of pancreatic progenitor marker (PDX1 and MNX1) expression, followed by pancreatic endocrine specification marker expression (BRN4, PAX4, ARX, NEUROD1, NKX6.1 and NKX2.2) and then pancreatic hormone expression (insulin, glucagon and somatostatin). Taken together these data suggest that initial cell seeding density plays an important role in both germ layer specification and pancreatic progenitor commitment, which precedes pancreatic endocrine cell formation. This work highlights the need to examine standard culture variables such as seeding density when optimizing hESC differentiation protocols.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations80
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONEMême sujetPancreatic function and diabetesTravaux en français237 207