Sapovirus in Water, Japan
Notice bibliographique
Résumé
Sapoviruses are etiologic agents of human gastroenteritis.We detected sapovirus in untreated wastewater, treated wastewater, and a river in Japan.A total of 7 of 69 water samples were positive by reverse transcription-PCR.Phylogenetic analysis of the viral capsid gene grouped these strains into 4 genetic clusters.T he family Caliciviridae contains 4 genera, Sapovirus, Norovirus, Lagovirus, and Vesivirus, which include sapovirus (SaV), norovirus (NoV), rabbit hemorrhagic disease virus, and feline calicivirus strains, respectively.SaV and NoV are agents of human gastroenteritis.The most widely used method of detection is reverse transcription-PCR (RT-PCR), which has a high sensitivity and can also be used for genetic analysis.Only a limited number of SaV studies have been conducted, although most studies have shown that SaV infections are more frequent in young children than in adults and that nearly all children are infected by 5 years of age.NoVs have been detected in oysters (and other shellfish), water from drinking fountains, ice, and community drinking water (1-4).Environmental studies of SaV have not been conducted.SaV strains can be divided into 5 genogroups (GI-GV), among which GI, GII, GIV, and GV infect humans; GIII infects porcine species.Phylogenetic studies have also designated SaV clusters or genotypes to further describe strains that differ by ≈10% in nucleotide or amino acid sequences.The purpose of this study was to identify and describe SaV strains in environmental samples, namely, untreated wastewater, treated wastewater, a river, and seawater, in Japan.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».