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Enregistrement W2037844266 · doi:10.3201/eid1301.061047

Sapovirus in Water, Japan

2007· article· en· W2037844266 sur OpenAlexaff
Grant S. Hansman, Daisuke Sano, You Ueki, Takahiro Imai, Oka T, Kazuhiko Katayama, Naokazu Takeda, Tatsuo Omura

Notice bibliographique

RevueEmerging infectious diseases · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral gastroenteritis research and epidemiology
Établissements canadiensHatch (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSapovirusPhylogenetic treeCapsidWastewaterBiologyVirologyGenotypeGeneMicrobiologyGeneticsVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sapoviruses are etiologic agents of human gastroenteritis.We detected sapovirus in untreated wastewater, treated wastewater, and a river in Japan.A total of 7 of 69 water samples were positive by reverse transcription-PCR.Phylogenetic analysis of the viral capsid gene grouped these strains into 4 genetic clusters.T he family Caliciviridae contains 4 genera, Sapovirus, Norovirus, Lagovirus, and Vesivirus, which include sapovirus (SaV), norovirus (NoV), rabbit hemorrhagic disease virus, and feline calicivirus strains, respectively.SaV and NoV are agents of human gastroenteritis.The most widely used method of detection is reverse transcription-PCR (RT-PCR), which has a high sensitivity and can also be used for genetic analysis.Only a limited number of SaV studies have been conducted, although most studies have shown that SaV infections are more frequent in young children than in adults and that nearly all children are infected by 5 years of age.NoVs have been detected in oysters (and other shellfish), water from drinking fountains, ice, and community drinking water (1-4).Environmental studies of SaV have not been conducted.SaV strains can be divided into 5 genogroups (GI-GV), among which GI, GII, GIV, and GV infect humans; GIII infects porcine species.Phylogenetic studies have also designated SaV clusters or genotypes to further describe strains that differ by ≈10% in nucleotide or amino acid sequences.The purpose of this study was to identify and describe SaV strains in environmental samples, namely, untreated wastewater, treated wastewater, a river, and seawater, in Japan.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,061

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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