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Enregistrement W2038004854 · doi:10.1039/c0ob00292e

Effect of Sr<sup>2+</sup>association on the tautomerization processes of uracil and its dithio- and diseleno-derivatives

2010· article· en· W2038004854 sur OpenAlexaff
Ane Bordagaray, Otília Mó, Manuel Yáñez, Russell J. Boyd

Notice bibliographique

RevueOrganic & Biomolecular Chemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCrystallography and molecular interactions
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryTautomerUracilMedicinal chemistryBiochemistryDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The structures and relative stabilities of the complexes formed by uracil and its thio- and seleno-derivatives with the Sr(2+) cation, in the gas phase, have been analyzed by means of G96LYP density functional theory (DFT) calculations. The attachment of the Sr(2+) cation to the heteroatom at position 4 is preferred systematically. Although the enolic forms of uracil and its derivatives should not be observed in the gas phase, the corresponding Sr(2+) complexes are the most stable. The enhanced stability of these tautomers is two-fold, on the one hand Sr(2+) interacts with two basic sites simultaneously, and on the other hand an aromatization of the six-membered ring takes place upon Sr(2+) association. Sr(2+) attachment also has a clear catalytic effect in the tautomerization processes involving uracil and its derivatives. This catalytic effect increases when oxygen is replaced by sulfur or selenium. The Sr(2+) binding energy with uracil and its derivatives is bigger than the tautomerization barriers connecting the dioxo forms with the corresponding enolic tautomers. Consequently, when associated with Sr(2+), all tautomers are energetically accessible and should all be observed in the gas phase.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,615

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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