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Enregistrement W2038036381 · doi:10.1139/w00-007

Overproduction in <i>Escherichia coli </i>of the pectin methylesterase A from <i>Erwinia chrysanthemi</i> 3937: One-step purification, biochemical characterization, and production of polyclonal antibodies

2000· article· en· W2038036381 sur OpenAlexvenueno aff
Franck Laurent, Alain Kotoujansky, Yves Bertheau

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePolysaccharides and Plant Cell Walls
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitut National de la Recherche Agronomique
Mots-clésPolyclonal antibodiesPectinEscherichia coliPectinasePectinesteraseDivalentErwiniaChemistryBiochemistryAffinity chromatographyPathogenPectate lyaseEnzymeBiologyMicrobiologyAntibodyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pectin methylesterase A (EC 3.1.1.11), one of the pathogenicity factors of Erwinia chrysanthemi strain 3937, was purified to homogeneity using one-step chromatography on cross-linked pectate. The purified protein showed maximum activity at pH 8-9, 50 degrees C, 50-100 mM monovalent cations or 5-10 mM divalent cations, and on a 50% esterified pectin. A particular effect of Ca2+ and Zn2+ on PMEA activity, due to the formation of a pectin gel, was observed. A Km value of 0.03% and 0.051% was determined at pH 6 and 7.6, respectively, using the same substrate. Polyclonal antibodies raised against the PMEA from E. chrysanthemi strain 3937 were produced. It recognized PMEs from Erwinia species, but did not cross-react with PME of fungal or plant origin, and will therefore be a useful tool to immunolocalize the protein during plant-pathogen interactions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,178
Écart entre enseignants0,169 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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