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Enregistrement W2038171923 · doi:10.1074/jbc.m007944200

Co-translational Interactions of Apoprotein B with the Ribosome and Translocon during Lipoprotein Assembly or Targeting to the Proteasome

2001· article· en· W2038171923 sur OpenAlexaff
Rajalakshmi Pariyarath, Hongxing Wang, John D. Aitchison, Henry N. Ginsberg, William J. Welch, Arthur E. Johnson, Edward A. Fisher

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésEndoplasmic reticulumApolipoprotein BProteasomeMicrosomal triglyceride transfer proteinTransloconLipid-anchored proteinCell biologyBiochemistryCytosolRibosomeChemistryLipoproteinBiologyVery low-density lipoproteinAutophagyCholesterolMembrane proteinEnzymeRNAApoptosisGeneMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hepatic lipoprotein assembly and secretion can be regulated by proteasomal degradation of newly synthesized apoB, especially if lipid synthesis or lipid transfer is low. Our previous studies in HepG2 cells showed that, under these conditions, newly synthesized apoB remains stably associated with the endoplasmic reticulum (ER) membrane (Mitchell, D. M., Zhou, M., Pariyarath, R., Wang, H., Aitchison, J. D., Ginsberg, H. N., and Fisher, E. A. (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 95, 14733-14738). We now show that independent of lipid synthesis, apoB chains that appear full-length are, in fact, incompletely translated polypeptides still engaged by the ribosome and associated with the ER translocon. In the presence of active lipid synthesis and transfer, translation and lipoprotein assembly are completed, and the complexes exit the ER. Upon omitting fatty acids from, or adding a microsomal triglyceride transfer protein inhibitor to, culture media to reduce lipid synthesis or transfer, respectively, apoB was degraded while it remained associated with the ER and complexed with cytosolic hsp70 and proteasomes. Thus, unlike other ER substrates of the proteasome, such as major histocompatibility complex class I molecules, apoB does not fully retrotranslocate to the cytosol before entering the ubiquitin-proteasome pathway. Although, upon immunofluorescence, apoB in proteasome-inhibited cells accumulated in punctate structures similar in appearance to aggresomes (cytosolic structures containing molecules irreversibly lost from the secretory pathway), these apoB molecules could be secreted when lipid synthesis was stimulated. The results suggest a model in which 1) apoB translation does not complete until lipoprotein assembly terminates, and 2) assembly with lipids or entry into the ubiquitin-proteasome pathway occurs while apoB polypeptides remain associated with the translocon and attached to the ribosome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations93
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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