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Enregistrement W2038974658 · doi:10.1074/jbc.m113.486654

Aggregatibacter actinomycetemcomitans Leukotoxin Utilizes a Cholesterol Recognition/Amino Acid Consensus Site for Membrane Association

2013· article· en· W2038974658 sur OpenAlexafffund
Angela C. Brown, Nataliya V. Balashova, Richard M. Epand, Alvina Bragin, Scott C. Kachlany, Michael Walters, Yurong Du, Kathleen Boesze‐Battaglia, Edward T. Lally

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Eye InstituteNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAggregatibacter actinomycetemcomitansAssociation (psychology)ChemistryCholesterolBiologyBiochemistryBacteriaGeneticsPsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aggregatibacter actinomycetemcomitans produces a repeats-in-toxin (RTX) leukotoxin (LtxA) that selectively kills human immune cells. Binding of LtxA to its β 2 integrin receptor (lymphocyte function-associated antigen-1 (LFA-1)) results in the clustering of the toxin·receptor complex in lipid rafts. Clustering occurs only in the presence of LFA-1 and cholesterol, and LtxA is unable to kill cells lacking either LFA-1 or cholesterol. Here, the interaction of LtxA with cholesterol was measured using surface plasmon resonance and differential scanning calorimetry. The binding of LtxA to phospholipid bilayers increased by 4 orders of magnitude in the presence of 40% cholesterol relative to the absence of cholesterol. The affinity was specific to cholesterol and required an intact secondary structure. LtxA contains two cholesterol recognition/amino acid consensus (CRAC) sites; CRAC 336 ( 333 LEEYSKR 339 ) is highly conserved among RTX toxins, whereas CRAC 503 ( 501 VDYLK 505 ) is unique to LtxA. A peptide corresponding to CRAC 336 inhibited the ability of LtxA to kill Jurkat (Jn.9) cells. Although peptides corresponding to both CRAC 336 and CRAC 503 bind cholesterol, only CRAC 336 competitively inhibited LtxA binding to this sterol. A panel of full-length LtxA CRAC mutants demonstrated that an intact CRAC 336 site was essential for LtxA cytotoxicity. The conservation of CRAC 336 among RTX toxins suggests that this mechanism may be conserved among RTX toxins. Background: A repeats-in-toxin (RTX) leukotoxin and its integrin receptor aggregate in cholesterol-rich lipid rafts. Results: The affinity of the toxin to cholesterol is driven by a cholesterol recognition/amino acid consensus (CRAC) motif. Conclusion: Leukotoxin cytotoxicity is regulated by the CRAC motif. Significance: Other RTX toxins contain this CRAC motif, suggesting a role for cholesterol recognition in RTX cytolysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,648

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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