Serendipitous discovery of a novel protostrongylid (Nematoda: Metastrongyloidea) in caribou, muskoxen, and moose from high latitudes of North America based on DNA sequence comparisons
Notice bibliographique
Résumé
Fecal samples are often the only feasible means to assess diversity of parasites in wildlife; however, definitive identification of egg or larval stages in feces by morphology is rarely possible. We determined partial sequences from the second internal transcribed spacer region (ITS-2) of nuclear ribosomal DNA for first-stage, dorsal-spined larvae (DSL) in feces from caribou ( Rangifer tarandus tarandus (L., 1758), Rangifer tarandus caribou (Gmelin, 1788), Rangifer tarandus grantii (Allen, 1902)), muskoxen ( Ovibos moschatus moschatus (Zimmermann, 1780), Ovibos moschatus wardi Lydekker, 1900), moose ( Alces alces gigas Miller, 1899 and Alces alces andersoni Peterson, 1952), and from the tissue of one slug ( Deroceras laeve (Müller, 1774)) in Arctic–Subarctic North America. A previously uncharacterized, genetically distinct species was recognized based on sequences of 37 DSL from 19 ungulate hosts and the slug. Sequence similarity among individuals of this novel species was 91%–100%. For many individual DSL, paralogues of ITS-2 were detected. ITS-2 sequences from the novel species were 72%–77% similar to those of Varestrongylus alpenae (Dikmans, 1935) and 51%–61% similar to those of other protostrongylids known in North American and some Eurasian ungulates. Results indicate a discrete lineage of an undescribed protostrongylid infecting muskoxen, caribou, and moose from Alaska to Labrador. Sympatric infections with Parelaphostrongylus andersoni Prestwood, 1972 were found in three caribou herds.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».