Genetic Analysis of Leishmania donovani Tropism Using a Naturally Attenuated Cutaneous Strain
Notice bibliographique
Résumé
A central question in Leishmania research is why most species cause cutaneous infections but others cause fatal visceral disease. Interestingly, L. donovani causes both visceral and cutaneous leishmaniasis in Sri Lanka. L. donovani clinical isolates were therefore obtained from cutaneous leishmaniasis (CL-SL) and visceral leishmaniasis (VL-SL) patients from Sri Lanka. The CL-SL isolate was severely attenuated compared to the VL-SL isolate for survival in visceral organs in BALB/c mice. Genomic and transcriptomic analysis argue that gene deletions or pseudogenes specific to CL-SL are not responsible for the difference in disease tropism and that single nucleotide polymorphisms (SNPs) and/or gene copy number variations play a major role in altered pathology. This is illustrated through the observations within showing that a decreased copy number of the A2 gene family and a mutation in the ras-like RagC GTPase enzyme in the mTOR pathway contribute to the attenuation of the CL-SL strain in visceral infection. Overall, this research provides a unique perspective on genetic differences associated with diverse pathologies caused by Leishmania infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».