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Enregistrement W2039840901 · doi:10.1080/21501203.2010.544334

Phylogeny and intercontinental distribution of the pneumocandin-producing anamorphic fungus <i>Glarea lozoyensis</i>

2011· article· en· W2039840901 sur OpenAlex
Fernando Peláez, Javier Collado, Gonzalo Platas, David P. Overy, Jesús Martı́n, Francisca Vicente, Antonio González del Val, Ángela Basilio, Mercedes de la Cruz, José R. Tormo, A. Fillola, F. Arenal, Vicente Rubio, Hans-Otto Baral, Ricardo Galán, Gerald F. Bills

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueMycology&#58 An International Journal on Fungal Biology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensUniversity of Prince Edward Island
Organismes subventionnairesU.S. Department of Agriculture
Mots-clésBiologyPhylogeneticsPhylogenetic treeConidiumMyceliumBotanyFungusMicrobiologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glarea lozoyensis is an anamorphic ascomycete that produces pneumocandin B0, the starting molecule for the synthesis of the antifungal drug caspofungin (CANCIDAS™). Glarea lozoyensis was first isolated in 1985 from a water sample from Madrid, Spain. Until now, only the original strain was known, but we have discovered new strains from Argentina and the USA. Molecular phylogenetic reference to a 28S rDNA database of antibiotic-producing fungi quickly identified these strains as being conspecific with G. lozoyensis. Bayesian inference phylogeny of ITS, 28S rDNA and α-actin gene fragments revealed that G. lozoyensis is related to species of the genus Cyathicula (Helotiales). Glarea lozoyensis was not conspecific with any of the Cyathicula species sequenced, although it appears to share a common ancestor. Glarea lozoyensis and Cyathicula strains were fermented on nutritional microarrays in 96-well plates. Cyathicula extracts did not show antifungal activity and did not produce pneumocandins, whereas potent antifungal activity and pneumocandin A0 production were confirmed for the four G. lozoyensis isolates. Also, culture morphology differed, with G. lozoyensis strains producing a dark brown, profusely sporulating mycelium with pigmented multicellular conidia accumulating in conidial masses, while all Cyathicula species tested in culture formed hyaline to light brown mycelia and lacked conidia. The chemistry and taxonomic distribution of the echinocandin class of antifungals is comprehensively reviewed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,684
Score d'incertitude au seuil0,553

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle