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Enregistrement W2040614951 · doi:10.1242/dev.051300

The time to measure positional information: maternal Hunchback is required for the synchrony of the Bicoid transcriptional response at the onset of zygotic transcription

2010· article· en· W2040614951 sur OpenAlexafffund
Aude Porcher, Asmahan Abu‐Arish, Sébastien Huart, Baptiste Roelens, Cécile Fradin, Nathalie Dostatni

Notice bibliographique

RevueDevelopment · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesCentre National de la Recherche ScientifiqueNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsInfrastructures en Biologie Santé et Agronomie
Mots-clésDrosophila embryogenesisBiologyMorphogenGap geneMitosisGeneticsCell biologyTranscription factorDrosophila melanogasterTranscription (linguistics)MorphogenesisGene expressionZygoteEmbryoGeneEmbryogenesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It is widely accepted that morphogenetic gradients determine cell identity by concentration-dependent activation of target genes. How precise is each step in the gene expression process that acts downstream of morphogens, however, remains unclear. The Bicoid morphogen is a transcription factor directly activating its target genes and provides thus a simple system to address this issue in a quantitative manner. Recent studies indicate that the Bicoid gradient is precisely established in Drosophila embryos after eight nuclear divisions (cycle 9) and that target protein expression is specified five divisions later (cycle 14), with a precision that corresponds to a relative difference of Bicoid concentration of 10%. To understand how such precision was achieved, we directly analyzed nascent transcripts of the hunchback target gene at their site of synthesis. Most anterior nuclei in cycle 11 interphasic embryos exhibit efficient biallelic transcription of hunchback and this synchronous expression is specified within a 10% difference of Bicoid concentration. The fast diffusion of Bcd-EGFP (7.7 mum(2)/s) that we captured by fluorescent correlation spectroscopy in the nucleus is consistent with this robust expression at cycle 11. However, given the interruption of transcription during mitosis, it remains too slow to be consistent with precise de novo reading of Bicoid concentration at each interphase, suggesting the existence of a memorization process that recalls this information from earlier cycles. The two anterior maternal morphogens, Bicoid and Hunchback, contribute differently to this early response: whereas Bicoid provides dose-dependent positional information along the axis, maternal Hunchback is required for the synchrony of the response and is therefore likely to be involved in this memorization process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,498
Score d'incertitude au seuil0,392

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations93
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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