Small‐Subunit rRNA Phylogenies Suggest That<i>Epalxella antiquorum</i>(Penard, 1922) Corliss, 1960 (Ciliophora, Odontostomatida) Is a Member of the Plagyopylea
Notice bibliographique
Résumé
The odontostomatid ciliates have remained a homogeneous order of ciliates since the 1930s when they were recognized as a monophyletic assemblage. Since that time they have been placed with the heterotrich ciliates, and more recently transferred as incertae sedis to the new "riboclass" class Armophorea. We were able to obtain the small subunit rRNA gene sequence of the odontostomatid Epalxella antiquorum (Penard, 1922) Corliss, 1960, collected from the meromictic alpine Lake Alat in Germany, in July 2005. An alignment with representatives of all 11 classes of ciliates unambiguously places the Epalxella sequence with other representatives of the class Plagiopylea with 100% support in both maximum likelihood and Bayesian analyses. Epalxella is the basal lineage with trimyemid and plagiopylid ciliates forming the two terminal sister clades. While this molecular support is strong and unambiguous, there are no obvious morphological features to unite these three clades. Thus, the class Plagiopylea must continue to be referred to as a "riboclass." Using the Epalxella sequence as a basal marker, we tentatively identified 20 environmental sequences to the terminal plagiopylean clades: eight to the genus Trimyema; four to the genus Plagiopyla; and eight to two new species, one of which might represent a new plagiopylean genus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».