Optimization of Immobilized Bacterial Disaccharides for Surface Plasmon Resonance Imaging Measurements of Antibody Binding
Notice bibliographique
Résumé
The interactions between proteins and immobilized carbohydrates are crucial to biological events such as cell signaling and immune response. The modification of surfaces with carbohydrates to create sensing platforms provides a pathway to study these interactions in a laboratory setting. In this work, a family of structurally related Salmonella disaccharide epitopes is immobilized on thin gold films in an array format to probe antibody binding with surface plasmon resonance (SPR) imaging. The disaccharides are modified with an alkyl thiol linker for facile immobilization to gold. Small differences in the stereochemistry of the immobilized, modified disaccharides are shown to greatly influence the binding of a monoclonal antibody. Specifically, binding is only observed to an immobilized abequose dideoxyhexose relative to a tyvelose or a paratose analogue. However, both the amount and relative strength of bound antibody depends on the distribution of disaccharide moieties in a mixed monolayer of the epitope and a nonbinding diluent molecule. We thoroughly characterize the mixed monolayers with a variety of techniques to understand the optimal density and distribution of the disaccharide for antibody capture. This work reinforces the importance of controlling the density of ligands at the interface for optimized surface based bioassays.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».